90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0388 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  100 
 
 
333 aa  666    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  31.99 
 
 
324 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  32.79 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  31.31 
 
 
332 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  30.46 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  29.94 
 
 
362 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  27.95 
 
 
332 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  27.86 
 
 
328 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  27.95 
 
 
332 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  27.95 
 
 
332 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  27.33 
 
 
332 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  27.64 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  27.33 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  29.62 
 
 
332 aa  165  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  29.62 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  29.61 
 
 
333 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  31.16 
 
 
327 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  29.34 
 
 
334 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  30.7 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  27.11 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  32.01 
 
 
328 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  28.18 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  26.67 
 
 
358 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  29 
 
 
336 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  32.28 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  24.72 
 
 
371 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  29.68 
 
 
325 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  27.91 
 
 
339 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  24.56 
 
 
356 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  29.93 
 
 
311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  32.14 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  24.77 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  28.83 
 
 
325 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  28.57 
 
 
325 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  29.2 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  27.44 
 
 
336 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  28.47 
 
 
325 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  29.15 
 
 
327 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  29.15 
 
 
327 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  29.15 
 
 
327 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  28.7 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  28.7 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  25.82 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  28.43 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  29.63 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  30.4 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  29.93 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  29.59 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  27.24 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  27.68 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  29.29 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  27 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  28.52 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  27.36 
 
 
272 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  25.29 
 
 
373 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  25.29 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  23.46 
 
 
417 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  24.29 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  24.29 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  24.86 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  23.82 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  25 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  23.82 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  27.73 
 
 
315 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  24.93 
 
 
374 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  25.82 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3078  general secretion pathway protein K  24.91 
 
 
367 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521903  hitchhiker  0.00000111178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4828  putative type II secretion system protein  30.92 
 
 
321 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  24.24 
 
 
431 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  19.94 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  31.47 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  20.83 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  26.42 
 
 
299 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4493  putative general secretory pathway protein K  23.44 
 
 
577 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171775  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  22.06 
 
 
357 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  20.77 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  23.02 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  27.42 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  30.07 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  28.43 
 
 
281 aa  46.2  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  25.84 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  21.93 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  27.94 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  28.78 
 
 
312 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>