103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0368 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  100 
 
 
1066 aa  2154    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  36.17 
 
 
1051 aa  615  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  36.15 
 
 
1057 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  36.19 
 
 
1061 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  33.77 
 
 
1116 aa  545  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  33.93 
 
 
1008 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  33.06 
 
 
1056 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  30.54 
 
 
1081 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  31.21 
 
 
1068 aa  386  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  29.92 
 
 
1041 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  27.7 
 
 
1097 aa  310  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 
1100 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  26.95 
 
 
1077 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  27.55 
 
 
1129 aa  280  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  26.11 
 
 
1071 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.41 
 
 
1125 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  27.18 
 
 
1105 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.53 
 
 
1074 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
1074 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  29.9 
 
 
1067 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  26.79 
 
 
1053 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  29.68 
 
 
1071 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  27.44 
 
 
1052 aa  128  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
1041 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  22.85 
 
 
1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  26.68 
 
 
1066 aa  117  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.52 
 
 
1125 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
993 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  26.18 
 
 
1122 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 
1176 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 
1232 aa  108  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  32.24 
 
 
1075 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 
1123 aa  101  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  22.95 
 
 
992 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  26.15 
 
 
1203 aa  95.5  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  28 
 
 
1195 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  27.38 
 
 
1010 aa  94.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.54 
 
 
1069 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  28.9 
 
 
1298 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  27.79 
 
 
1162 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 
1008 aa  92.4  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
1149 aa  92  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  26.98 
 
 
1008 aa  89.4  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  26.52 
 
 
1075 aa  87.8  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
991 aa  87.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 
972 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.08 
 
 
1122 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.08 
 
 
1120 aa  85.9  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 
1188 aa  82.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.74 
 
 
1257 aa  81.6  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.27 
 
 
1126 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
1026 aa  80.1  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  26.99 
 
 
994 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 
1066 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
1114 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
1167 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
1105 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  23.25 
 
 
1007 aa  75.1  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  26.01 
 
 
1162 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 
1016 aa  73.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  25.24 
 
 
1161 aa  72.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  27.91 
 
 
1194 aa  72  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.63 
 
 
997 aa  72  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.33 
 
 
511 aa  72  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  25.25 
 
 
1001 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  28.08 
 
 
1196 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  25.16 
 
 
1173 aa  71.6  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.18 
 
 
1109 aa  71.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
1105 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
1066 aa  69.7  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  26.81 
 
 
1210 aa  69.3  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 
1123 aa  68.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 
1007 aa  66.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  29.01 
 
 
979 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
1065 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
897 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
1206 aa  64.7  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
888 aa  64.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 
1054 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.91 
 
 
1050 aa  62.4  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  23.66 
 
 
1141 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  21.5 
 
 
1007 aa  61.6  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  24.37 
 
 
986 aa  61.6  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  27.62 
 
 
1132 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  26.44 
 
 
1012 aa  58.2  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  20.94 
 
 
1037 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 
1153 aa  55.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4161  hypothetical protein  27.24 
 
 
1008 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000881228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 
760 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
1124 aa  53.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
952 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
1087 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
1010 aa  49.3  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
1089 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2212  putative TonB dependent receptor  35.71 
 
 
862 aa  48.1  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  23.49 
 
 
1194 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.33 
 
 
966 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 
727 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 
806 aa  45.8  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  25.73 
 
 
724 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>