More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0315 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  50.31 
 
 		 786 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  54.01 
 
 		 771 aa  768    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 770 aa  1546    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  43.34 
 
 		 745 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  42.97 
 
 		 743 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 774 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  38.59 
 
 		 750 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  39.41 
 
 		 758 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 758 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 758 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  38.13 
 
 		 758 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 792 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 728 aa  428  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 790 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 790 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 780 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 775 aa  244  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 755 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 765 aa  241  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 730 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 722 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 729 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 730 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 		 776 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.96 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 704 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 749 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 783 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 732 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 754 aa  211  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 780 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 723 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 734 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 		 751 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 710 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 764 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 753 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 769 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 832 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 784 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 762 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 787 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 747 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 784 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 794 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 758 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 763 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 785 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 733 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 741 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 771 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 765 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 779 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 796 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 809 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 862 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 769 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 726 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 825 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 761 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 741 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 773 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 771 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 769 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 793 aa  171  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.41 
 
 		 755 aa  170  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 773 aa  170  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 873 aa  170  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 783 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  26.38 
 
 		 786 aa  167  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 725 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 803 aa  167  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 736 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.29 
 
 		 754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 737 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 767 aa  164  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 731 aa  164  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 796 aa  164  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 795 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 771 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 778 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 817 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 774 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 840 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>