More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0300 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  486  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 217 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 226 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 222 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 226 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  39.59 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 223 aa  131  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 223 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  37.67 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.75 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  39.09 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  34.01 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  34.01 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  30.37 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.83 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.9 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  34.66 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 229 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 221 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>