More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0264 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.95 
 
 
226 aa  230  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.39 
 
 
226 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  56.77 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  55.02 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  51.11 
 
 
233 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.41 
 
 
225 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.87 
 
 
231 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
237 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  52.84 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  51.97 
 
 
237 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  51.97 
 
 
237 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  51.97 
 
 
237 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
222 aa  184  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  50 
 
 
241 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
234 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
234 aa  161  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
237 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 
246 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
228 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
234 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
237 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  48.26 
 
 
1695 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4854  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0657212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.16 
 
 
233 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
236 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
244 aa  134  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
235 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
236 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
237 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
235 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
235 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4813  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.52 
 
 
239 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.4 
 
 
231 aa  118  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
282 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
256 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  35.15 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.11 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.85 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
233 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
250 aa  108  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
233 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
236 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
257 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
236 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
233 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
251 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
231 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
224 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
250 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.18 
 
 
251 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
260 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.2 
 
 
256 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
254 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  30.99 
 
 
248 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.17 
 
 
247 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
275 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.240969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  30.99 
 
 
248 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
262 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
255 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.19 
 
 
242 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000197068  decreased coverage  0.00245828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
268 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
249 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  31.95 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0521  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.35 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169063  hitchhiker  0.0028049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0457  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.92 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2462  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.131471  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.29 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.51 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.15 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.54 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.96 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 
253 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
252 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.17 
 
 
248 aa  95.9  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
262 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
247 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
247 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6964  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.75 
 
 
259 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>