More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0258 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  71.17 
 
 		 432 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  874    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  55.5 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  52.64 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  54.06 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  44.12 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 424 aa  246  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 430 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 430 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 430 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  32.58 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  32.36 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  32.36 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  32.36 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  32.36 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 427 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 454 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 431 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  34.09 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 430 aa  223  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.94 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  34.27 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.84 
 
 		 433 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.84 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  30.84 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 429 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  30.77 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  31.24 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 431 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  31.21 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  31.21 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  31.21 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  31.14 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  30.54 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  30.52 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  30.52 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  29.71 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  30.77 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  31.07 
 
 		 474 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  32.34 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  30.91 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  31.21 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  31.21 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  31.21 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  31.21 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  33.11 
 
 		 436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  30.96 
 
 		 439 aa  194  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 501 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  33.33 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 429 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 445 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  30.73 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 430 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 441 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  29.82 
 
 		 439 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  29.93 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 435 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 441 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>