218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0253 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2991  hypothetical protein  45.38 
 
 		 1013 aa  813    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000283322  hitchhiker  0.000000325565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0253  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1011 aa  2036    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0016718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2065  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 963 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0696  hypothetical protein  33.43 
 
 		 970 aa  478  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000664901  unclonable  0.0000000149874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1386  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000408374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0286  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 976 aa  252  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1315  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 988 aa  238  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1888  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 		 942 aa  237  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3075  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 988 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  25.75 
 
 		 959 aa  231  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 885 aa  228  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1693  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 1007 aa  225  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1661  TonB dependent receptor-related protein  24.88 
 
 		 940 aa  224  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1940  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1010 aa  220  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0559  TonB dependent receptor-related protein  24.88 
 
 		 960 aa  219  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2134  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 939 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2210  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 939 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.922115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2312  1-(5-phosphoribosyl)-5-  25.19 
 
 		 941 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2288  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 940 aa  214  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1826  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 961 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000380617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01881  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1016 aa  207  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.529383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1115  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 943 aa  202  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3880  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 901 aa  199  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000233231  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2209  outer membrane insertion C-terminal signal  25.39 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.368358  hitchhiker  0.00248616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1787  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 906 aa  189  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2300  outer membrane insertion C-terminal signal  25.17 
 
 		 908 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417684  normal  0.431246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2085  outer membrane insertion C-terminal signal  24.88 
 
 		 908 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2038  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 908 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2162  tonB dependent receptor-related protein  24.84 
 
 		 836 aa  183  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2735  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.692321  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1289  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 978 aa  182  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.384181  normal  0.0181603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2390  argininosuccinate synthase  22.97 
 
 		 1109 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0671572  decreased coverage  0.00000572722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2029  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 908 aa  178  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1018  outer membrane insertion C-terminal signal  23.83 
 
 		 918 aa  177  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3052  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 914 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00121145  hitchhiker  0.00160966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3658  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 894 aa  173  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000529839  normal  0.386646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01879  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 938 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3396  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 881 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3638  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 993 aa  164  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000344146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0288  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 929 aa  162  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1838  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 979 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.534381  hitchhiker  0.00298176 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 957 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2359  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 915 aa  150  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.975634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3737  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 994 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0682  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 908 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000218654  hitchhiker  0.000000544353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1397  nucleoside diphosphate kinase  21.4 
 
 		 986 aa  145  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.03521  decreased coverage  0.000000213589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0295  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 964 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.050609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1180  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 998 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000103368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2079  TonB-dependent receptor  21.89 
 
 		 994 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000280363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1144  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 998 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1213  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 998 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0027404  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3177  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 998 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0554366  normal  0.201208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2063  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 945 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 931 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3339  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 921 aa  132  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000713907  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4091  outer membrane insertion C-terminal signal  38.92 
 
 		 919 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.798393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1070  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 912 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299075  normal  0.0342154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0181  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 911 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1859  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 888 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2921  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 859 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2537  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 951 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2604  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 951 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4082  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 904 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2703  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 951 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1125  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 944 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 935 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1840  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 880 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00015166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 922 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2296  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 934 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4006  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 984 aa  115  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000010552  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03899  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 958 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1888  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 906 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0505133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3035  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 892 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000163798  decreased coverage  0.00000214604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2720  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 1009 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.000000258905  normal  0.119134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2924  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 875 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.409448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4482  hypothetical protein  32.31 
 
 		 312 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0866  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 924 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0993  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 946 aa  107  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.609458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2137  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 1013 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255977  normal  0.143212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 958 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2288  peptidase M24A  31.44 
 
 		 927 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000032845  unclonable  0.0000000380326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2085  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 945 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000059831  decreased coverage  0.00000000324721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2502  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  26.28 
 
 		 968 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0144507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1865  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 573 aa  105  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0741  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 918 aa  104  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0701962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0304  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 880 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1192  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 948 aa  104  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1093  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 1158 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000168671  normal  0.12204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1101  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 1011 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000197247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2123  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 925 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.154655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2048  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 944 aa  102  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00100179  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1305  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 900 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.988822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 936 aa  101  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0292  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 927 aa  101  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.73906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3836  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 1097 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.666807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0938  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 881 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.268052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0122  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 964 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00390144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 936 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 936 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>