More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0123 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  69.31 
 
 
192 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  72.32 
 
 
178 aa  255  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  70 
 
 
173 aa  247  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  67.23 
 
 
178 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  65.93 
 
 
204 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  74.71 
 
 
173 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  64.12 
 
 
173 aa  234  7e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  56.85 
 
 
202 aa  231  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  64.71 
 
 
173 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  64.12 
 
 
176 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 
174 aa  228  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  62.35 
 
 
173 aa  224  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  63.31 
 
 
175 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  62.94 
 
 
173 aa  221  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  70.86 
 
 
151 aa  220  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  58.16 
 
 
219 aa  220  1e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.73336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  61.76 
 
 
173 aa  219  2e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  61.76 
 
 
176 aa  219  2e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  62.35 
 
 
173 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 
192 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  67.65 
 
 
173 aa  216  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  58.24 
 
 
194 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  58.24 
 
 
194 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  58.24 
 
 
194 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  58.73 
 
 
200 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  61.18 
 
 
171 aa  213  1e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  79.39 
 
 
134 aa  213  2e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  79.39 
 
 
134 aa  213  2e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  60.59 
 
 
171 aa  211  5e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  59.41 
 
 
173 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  62.42 
 
 
169 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  74.05 
 
 
132 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  60.36 
 
 
173 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  56.44 
 
 
173 aa  196  2e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1768  translation initiation factor IF-3  53.19 
 
 
221 aa  191  7e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.40976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 
190 aa  191  9e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  65.03 
 
 
145 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  54.02 
 
 
178 aa  188  6e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  54.02 
 
 
178 aa  187  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
173 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  62.68 
 
 
144 aa  185  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  67.18 
 
 
132 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 
180 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  67.94 
 
 
132 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  54.27 
 
 
171 aa  182  2e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  62.41 
 
 
137 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 
182 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.64089e-06  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  53.99 
 
 
173 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  54.32 
 
 
163 aa  179  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  54.75 
 
 
180 aa  179  3e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  54.75 
 
 
180 aa  179  3e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  54.75 
 
 
180 aa  179  3e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.76935e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 
178 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  53.16 
 
 
194 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  51.53 
 
 
207 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  50.3 
 
 
182 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
180 aa  174  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
180 aa  174  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  54.49 
 
 
159 aa  173  1e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  57.75 
 
 
146 aa  173  2e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88109e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
172 aa  173  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
166 aa  173  2e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  4.66118e-05  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  56.1 
 
 
180 aa  172  3e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
238 aa  172  3e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  62.31 
 
 
137 aa  172  3e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  57.32 
 
 
180 aa  172  4e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
225 aa  171  7e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  52.5 
 
 
185 aa  171  8e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  50.31 
 
 
187 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  56.95 
 
 
155 aa  170  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.3 
 
 
184 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 
164 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.41 
 
 
219 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
171 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  9.64088e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  59.15 
 
 
146 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  51.55 
 
 
173 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 
165 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  52.15 
 
 
197 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  51.53 
 
 
227 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  50.62 
 
 
243 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  43.85 
 
 
202 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  50.92 
 
 
198 aa  167  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
169 aa  167  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  50.99 
 
 
154 aa  167  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.20038e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  46.63 
 
 
179 aa  167  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
172 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 
156 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
183 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 
183 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>