More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0099 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  100 
 
 
208 aa  401  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  57.64 
 
 
216 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  58.05 
 
 
208 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  56.16 
 
 
216 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  57.56 
 
 
211 aa  204  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  55.83 
 
 
212 aa  203  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  57.28 
 
 
208 aa  202  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  50.25 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  49.51 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  50.73 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  53.88 
 
 
203 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  47.78 
 
 
215 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  50 
 
 
214 aa  191  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  52.2 
 
 
208 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  49.51 
 
 
218 aa  189  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  47.78 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  56.31 
 
 
211 aa  188  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  58.45 
 
 
217 aa  188  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  55.83 
 
 
206 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  51.72 
 
 
212 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  49.75 
 
 
212 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  54.37 
 
 
211 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  55.83 
 
 
194 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  53.3 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  48.77 
 
 
212 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  54.9 
 
 
212 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  45.32 
 
 
217 aa  177  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  50.25 
 
 
212 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  51.92 
 
 
222 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  49.26 
 
 
212 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  43.75 
 
 
215 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  53.62 
 
 
217 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  53.85 
 
 
222 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  53.85 
 
 
222 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  52.66 
 
 
209 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  50.25 
 
 
209 aa  174  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  48.77 
 
 
212 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  55.03 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  50.98 
 
 
212 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  41.82 
 
 
225 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.67 
 
 
667 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  43.38 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.25 
 
 
218 aa  160  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  40.91 
 
 
229 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  40.87 
 
 
225 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  41.75 
 
 
233 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.28 
 
 
221 aa  158  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  41.36 
 
 
229 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3284  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.24 
 
 
679 aa  158  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185076  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.57 
 
 
643 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  38.81 
 
 
233 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  44.08 
 
 
225 aa  156  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  40.72 
 
 
240 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.07 
 
 
224 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.14 
 
 
226 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.14 
 
 
226 aa  155  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  39.91 
 
 
237 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.78 
 
 
228 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.36 
 
 
231 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.73 
 
 
231 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  39.15 
 
 
219 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.99 
 
 
699 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  38.53 
 
 
229 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  37.16 
 
 
226 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  38.86 
 
 
227 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  39.91 
 
 
229 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  44.14 
 
 
237 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  44.23 
 
 
228 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  41.94 
 
 
234 aa  151  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.12 
 
 
674 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  41.89 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  40.27 
 
 
224 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.94 
 
 
705 aa  150  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  38.25 
 
 
230 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2581  cytidylate kinase  38.25 
 
 
230 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000568011  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  43.87 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.02 
 
 
668 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  40.64 
 
 
227 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2669  cytidylate kinase  38.25 
 
 
230 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410063  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3014  cytidylate kinase  37.73 
 
 
228 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000196489  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  36.36 
 
 
230 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.04 
 
 
226 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  42.23 
 
 
227 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  41.55 
 
 
229 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  43.4 
 
 
228 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.66 
 
 
670 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  38.21 
 
 
225 aa  149  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  37.61 
 
 
226 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00914  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  41.87 
 
 
219 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1071  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000134482  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1016  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000287427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00921  hypothetical protein  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2418  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000459306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1007  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000820305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  39.55 
 
 
227 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  37.61 
 
 
230 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>