More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0088 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  100 
 
 
397 aa  808  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  48.13 
 
 
438 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  46.12 
 
 
442 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  51.13 
 
 
447 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.1019e-06 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  48.15 
 
 
441 aa  328  1e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  47.86 
 
 
441 aa  328  1e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  48.39 
 
 
438 aa  327  2e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  47.61 
 
 
441 aa  327  2e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  47.24 
 
 
442 aa  326  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  46.94 
 
 
442 aa  325  8e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  47.86 
 
 
441 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  46.29 
 
 
448 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  48.53 
 
 
441 aa  321  1e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  47.01 
 
 
447 aa  321  1e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 
442 aa  320  2e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  47.84 
 
 
437 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  44.31 
 
 
442 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  47.42 
 
 
441 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  44.42 
 
 
430 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  45.77 
 
 
447 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  45.91 
 
 
448 aa  315  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  47.99 
 
 
444 aa  307  2e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  45.45 
 
 
423 aa  305  8e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  44.13 
 
 
421 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  43.18 
 
 
447 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  43.81 
 
 
470 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  45.97 
 
 
422 aa  286  6e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  43.81 
 
 
442 aa  284  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  42.09 
 
 
442 aa  283  3e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  42.33 
 
 
440 aa  283  4e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  45.45 
 
 
412 aa  275  1e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  40.2 
 
 
440 aa  274  2e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  44.94 
 
 
424 aa  268  9e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  43.8 
 
 
435 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  46.51 
 
 
422 aa  259  5e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  40.45 
 
 
467 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 
424 aa  254  1e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  42.89 
 
 
432 aa  254  1e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  38.05 
 
 
429 aa  247  3e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  37.97 
 
 
434 aa  243  5e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  37.97 
 
 
435 aa  230  3e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  40.1 
 
 
453 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  41.12 
 
 
437 aa  225  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  38.46 
 
 
435 aa  223  5e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  38.92 
 
 
426 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  37.94 
 
 
442 aa  218  2e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  38.17 
 
 
424 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
434 aa  197  2e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.68 
 
 
425 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.67 
 
 
425 aa  196  8e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.14 
 
 
431 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  36.95 
 
 
443 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  35.07 
 
 
427 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  35.31 
 
 
425 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  37.18 
 
 
424 aa  184  2e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  40.77 
 
 
422 aa  184  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  41.18 
 
 
437 aa  183  5e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  38.64 
 
 
422 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.62 
 
 
427 aa  182  9e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.94 
 
 
457 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  37.69 
 
 
424 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  36.64 
 
 
381 aa  180  5e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  37.31 
 
 
432 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  34.13 
 
 
440 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  33.83 
 
 
437 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  32.76 
 
 
438 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  36.67 
 
 
424 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  37.06 
 
 
432 aa  177  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.22 
 
 
439 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  34.01 
 
 
432 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
418 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  32.43 
 
 
418 aa  175  1e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.42 
 
 
428 aa  175  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
438 aa  174  3e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.19 
 
 
432 aa  173  4e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  34.61 
 
 
435 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  35.33 
 
 
425 aa  173  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  33.08 
 
 
428 aa  173  6e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  38.89 
 
 
386 aa  172  8e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  34.2 
 
 
423 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
423 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
425 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  34.66 
 
 
443 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
423 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
423 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  28.5 
 
 
419 aa  170  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  34.11 
 
 
423 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  33.99 
 
 
447 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  34.88 
 
 
429 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  32.31 
 
 
421 aa  169  9e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  35.14 
 
 
437 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  33.76 
 
 
412 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 
421 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
422 aa  168  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  38.13 
 
 
403 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  33.25 
 
 
435 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  31.89 
 
 
432 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1092  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 
410 aa  167  3e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  31.34 
 
 
431 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  34.88 
 
 
453 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>