More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0087 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  100 
 
 
106 aa  217  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  70.75 
 
 
106 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  68.93 
 
 
104 aa  157  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  67.31 
 
 
111 aa  158  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  67.31 
 
 
108 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  61.39 
 
 
112 aa  147  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  57.55 
 
 
106 aa  146  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  61.32 
 
 
106 aa  146  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  61.39 
 
 
108 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  60.78 
 
 
110 aa  144  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  61.39 
 
 
108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  61.39 
 
 
108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  61.39 
 
 
108 aa  144  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  60 
 
 
107 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  59.41 
 
 
108 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  59.41 
 
 
108 aa  142  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  60.19 
 
 
107 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  58.42 
 
 
109 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  58.42 
 
 
109 aa  140  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  58.42 
 
 
108 aa  141  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  140  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  140  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  57.14 
 
 
106 aa  139  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  59.41 
 
 
108 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  59.22 
 
 
109 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  59.41 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  58.42 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  58.42 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  56.19 
 
 
106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  53.77 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  56.31 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  56.19 
 
 
119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  58.42 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  58.76 
 
 
108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  56.7 
 
 
108 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  58.25 
 
 
108 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  138  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  56.7 
 
 
108 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  56.7 
 
 
108 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  56.7 
 
 
108 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  57.28 
 
 
109 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  55.88 
 
 
107 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  137  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  53.4 
 
 
110 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  56.31 
 
 
109 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  54.64 
 
 
108 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  54.64 
 
 
108 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  54.64 
 
 
108 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  54.72 
 
 
106 aa  135  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  135  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  54.64 
 
 
108 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  58 
 
 
108 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  57.28 
 
 
109 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  56.6 
 
 
107 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  56.19 
 
 
108 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  53.4 
 
 
110 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  53.4 
 
 
110 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  56.7 
 
 
108 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  57.28 
 
 
109 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  57.43 
 
 
108 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  58 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  54.46 
 
 
109 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  54.64 
 
 
108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  57.43 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  54.37 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  55.77 
 
 
107 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  55.34 
 
 
108 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  55.34 
 
 
108 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  52.43 
 
 
110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  52.38 
 
 
107 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  56 
 
 
112 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  56 
 
 
112 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  53.47 
 
 
108 aa  133  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0036  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0705575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  56.44 
 
 
108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  50.49 
 
 
111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  52.48 
 
 
110 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>