87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0085 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 1016 aa  1992    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  41.03 
 
 		 1001 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  40.06 
 
 		 999 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  36.37 
 
 		 1048 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1049 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  39.79 
 
 		 1015 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  37.37 
 
 		 1047 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1049 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  37.59 
 
 		 1045 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  36.65 
 
 		 1048 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  37.19 
 
 		 1047 aa  476  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  38.08 
 
 		 1018 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  35.98 
 
 		 1042 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1042 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  36.18 
 
 		 1049 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  34.38 
 
 		 1076 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1053 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  35.2 
 
 		 1052 aa  439  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  35.96 
 
 		 1052 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1052 aa  435  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  34.08 
 
 		 1059 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  36.8 
 
 		 1037 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  34.03 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  32.9 
 
 		 1062 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  35.89 
 
 		 1000 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  35.18 
 
 		 997 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  35.08 
 
 		 997 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  35.94 
 
 		 1040 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  35.89 
 
 		 1054 aa  406  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  33.36 
 
 		 1064 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  35.46 
 
 		 1014 aa  395  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  33.53 
 
 		 977 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  34.8 
 
 		 991 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  33.89 
 
 		 1064 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  30.29 
 
 		 1047 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  33.24 
 
 		 986 aa  362  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  33.46 
 
 		 991 aa  340  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  30.04 
 
 		 993 aa  331  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.19 
 
 		 988 aa  316  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  35.71 
 
 		 959 aa  311  4e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  34.1 
 
 		 980 aa  293  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  22.44 
 
 		 890 aa  140  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  20.67 
 
 		 914 aa  132  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.69 
 
 		 911 aa  129  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.1 
 
 		 962 aa  90.5  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  27.27 
 
 		 976 aa  86.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  23.51 
 
 		 911 aa  84.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.68 
 
 		 855 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  30.56 
 
 		 989 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.71 
 
 		 947 aa  75.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.89 
 
 		 957 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.04 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  26.71 
 
 		 951 aa  68.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  33.18 
 
 		 864 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.59 
 
 		 846 aa  67.4  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  25.36 
 
 		 896 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  23.51 
 
 		 909 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.99 
 
 		 958 aa  66.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25 
 
 		 957 aa  65.9  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  21.22 
 
 		 919 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1000 aa  63.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  27.78 
 
 		 912 aa  63.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.97 
 
 		 951 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.6 
 
 		 1083 aa  59.3  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.8 
 
 		 856 aa  59.3  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.87 
 
 		 908 aa  59.7  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  23.43 
 
 		 994 aa  59.7  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  25.96 
 
 		 913 aa  58.2  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  27.27 
 
 		 1106 aa  57.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.41 
 
 		 984 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  24.09 
 
 		 872 aa  57  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  21.5 
 
 		 779 aa  55.5  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.53 
 
 		 906 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  23.81 
 
 		 862 aa  54.3  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.8 
 
 		 916 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  27.75 
 
 		 930 aa  51.6  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 1096 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.63 
 
 		 986 aa  48.5  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  33.05 
 
 		 142 aa  48.5  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 		 1144 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  33.33 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.96 
 
 		 1016 aa  47  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.73 
 
 		 915 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  40.26 
 
 		 1052 aa  45.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  29.23 
 
 		 1055 aa  45.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  26.16 
 
 		 990 aa  44.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>