90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0079 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.97 
 
 
203 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  43.86 
 
 
203 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.5 
 
 
203 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  45 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  42.11 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  38.96 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  42.31 
 
 
334 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  42.11 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  32.5 
 
 
349 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  36.99 
 
 
203 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  39.71 
 
 
371 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  42.11 
 
 
202 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  50.88 
 
 
277 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  39.71 
 
 
371 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  44.26 
 
 
223 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  42.25 
 
 
260 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  40 
 
 
340 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  37.1 
 
 
259 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  36.36 
 
 
458 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  38.46 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.58 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  37.36 
 
 
228 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  38.6 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.14 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  34.67 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.62 
 
 
368 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  42.11 
 
 
390 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  40.26 
 
 
462 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  33.33 
 
 
203 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  36.84 
 
 
207 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  30.09 
 
 
209 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.84 
 
 
206 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  36.07 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  36.07 
 
 
256 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  35.09 
 
 
205 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.88 
 
 
403 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.84 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  35.09 
 
 
206 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  36.07 
 
 
252 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  36.84 
 
 
219 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  36.51 
 
 
244 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.84 
 
 
206 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.09 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.09 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.84 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  36.51 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  36.51 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  36.51 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  35.06 
 
 
215 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  36.51 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  36.51 
 
 
239 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  37.5 
 
 
242 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  36.51 
 
 
244 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  36.51 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  36.51 
 
 
243 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  38.6 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  32.89 
 
 
342 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.84 
 
 
207 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  38.6 
 
 
276 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30.12 
 
 
223 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.35 
 
 
221 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  35.53 
 
 
225 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.75 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  36.07 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  38.6 
 
 
264 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.35 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  38.6 
 
 
270 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  36.07 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.51 
 
 
249 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  30.14 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  24.19 
 
 
405 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  34.43 
 
 
240 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  34.43 
 
 
242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  34.43 
 
 
242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  34.43 
 
 
242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  36.84 
 
 
202 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  37.04 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.92 
 
 
206 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  35.09 
 
 
212 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  38.6 
 
 
202 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.33 
 
 
248 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  37.88 
 
 
108 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  37.88 
 
 
108 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>