88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0072 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  393  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  38.89 
 
 
194 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  41.67 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  36.71 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  34.39 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  33.54 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  33.54 
 
 
227 aa  84.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  32.26 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  32.92 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  26.46 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  32.53 
 
 
250 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  27.51 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  27.37 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  39.8 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  26.46 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  28.57 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  32.09 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  35.62 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  30.72 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  33.54 
 
 
477 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  26.56 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  32.47 
 
 
192 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  29.51 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  27.57 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  32.72 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  35.95 
 
 
476 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  27.01 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  29.38 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  27.89 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  29.3 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  30.64 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  32.43 
 
 
492 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  36.11 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  34.72 
 
 
432 aa  62  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  31.85 
 
 
469 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  29.94 
 
 
488 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  32.64 
 
 
482 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  31.08 
 
 
476 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  30.67 
 
 
445 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  34.62 
 
 
482 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  29.52 
 
 
470 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  32.61 
 
 
465 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  33.87 
 
 
459 aa  54.7  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  31.03 
 
 
462 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  26.63 
 
 
464 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.58 
 
 
427 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  29.75 
 
 
482 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  29.93 
 
 
798 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  33.06 
 
 
478 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  26.67 
 
 
435 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  31.08 
 
 
490 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  31.98 
 
 
438 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  32.58 
 
 
462 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  31.76 
 
 
472 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  28.57 
 
 
445 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  31.29 
 
 
442 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  28.74 
 
 
479 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  35.4 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 
480 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  27.01 
 
 
512 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  27.13 
 
 
490 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  28.92 
 
 
465 aa  48.9  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  26.19 
 
 
452 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  30 
 
 
481 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  28.32 
 
 
470 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  31.25 
 
 
493 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  29.69 
 
 
436 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  27.48 
 
 
488 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.28 
 
 
421 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  28.48 
 
 
474 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  26.32 
 
 
336 aa  45.1  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  27.4 
 
 
484 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  25.85 
 
 
467 aa  45.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  31.11 
 
 
479 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  24.09 
 
 
347 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  31.11 
 
 
479 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  31.11 
 
 
479 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  29.85 
 
 
471 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  24.81 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  28.8 
 
 
485 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 
461 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  27.74 
 
 
447 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  38.38 
 
 
473 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  30.82 
 
 
473 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  29.45 
 
 
459 aa  41.2  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  31.11 
 
 
445 aa  41.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>