More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0067 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  648    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  65.5 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  64.38 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  61.66 
 
 		 336 aa  384  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  60.44 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  59.8 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  58.63 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  58.96 
 
 		 319 aa  352  5.9999999999999994e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  57.98 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  56.8 
 
 		 335 aa  319  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  46.23 
 
 		 316 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.22 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.22 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  43.73 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  47.9 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  43.49 
 
 		 318 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  46.21 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  46.21 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  44.44 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  42.58 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  44.34 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  45.48 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  42.95 
 
 		 309 aa  255  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  41.94 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  45.54 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  42.95 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  45.21 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  43.04 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  44 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 306 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  43.42 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  42.43 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 313 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  44.88 
 
 		 321 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  44.04 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  44.88 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  43.09 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  45.36 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  45.36 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  45.21 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  42.43 
 
 		 306 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  41.48 
 
 		 320 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  42.44 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 316 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  40.19 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  41.18 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  43.27 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  41.94 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  44.85 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  42.11 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  42.3 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  40.58 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  45.36 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.87 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  44.85 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 		 308 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  46.95 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  42.26 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.41 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  41.42 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  45.07 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  41.31 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.42 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  41.78 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  41.48 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  41.42 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  42.44 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  41.42 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4520  ABC transporter related  43.59 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  46.69 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  41.58 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  42.3 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  42.56 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  41.45 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  41.48 
 
 		 310 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  42.56 
 
 		 308 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  44.22 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  41.49 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  41.64 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  44.25 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2407  ABC transporter related  42.44 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  41.48 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  41.83 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.79 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>