More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0060 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  100 
 
 
503 aa  999    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  46.23 
 
 
456 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  44.84 
 
 
457 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  45.15 
 
 
456 aa  382  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  44.96 
 
 
458 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  45.17 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  45.17 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  45.17 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  45.17 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  46.28 
 
 
460 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  44.33 
 
 
459 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  44.75 
 
 
459 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  44.96 
 
 
457 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  44.75 
 
 
459 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  46.89 
 
 
453 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  47.31 
 
 
467 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  43.93 
 
 
449 aa  360  4e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  47.11 
 
 
461 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  44.42 
 
 
464 aa  342  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  45.25 
 
 
447 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  43.91 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  46.07 
 
 
456 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  41.53 
 
 
455 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  40.5 
 
 
505 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  47.54 
 
 
464 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.32 
 
 
455 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  46.88 
 
 
449 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41.12 
 
 
455 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41.12 
 
 
455 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.12 
 
 
455 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  40.91 
 
 
455 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41.12 
 
 
455 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  40.91 
 
 
455 aa  330  3e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  41.2 
 
 
463 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  41.44 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  40.91 
 
 
455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  42.76 
 
 
448 aa  327  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  45.05 
 
 
458 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  43.49 
 
 
445 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  40.79 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  46.14 
 
 
447 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  40.12 
 
 
462 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  40.25 
 
 
456 aa  316  5e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  39.54 
 
 
460 aa  316  8e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  44.03 
 
 
459 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  42.49 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  42.32 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  39.87 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  40.42 
 
 
458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  42.25 
 
 
443 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  39.87 
 
 
445 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  43.87 
 
 
452 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  43.02 
 
 
458 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  42.53 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  38.54 
 
 
460 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  40.04 
 
 
458 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  40.67 
 
 
458 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  42.83 
 
 
457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  41.86 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  42.19 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  39.54 
 
 
472 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  38.78 
 
 
498 aa  300  3e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  42.6 
 
 
435 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  39.63 
 
 
494 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  42.51 
 
 
452 aa  299  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  43.07 
 
 
446 aa  299  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  43.76 
 
 
448 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  42.47 
 
 
452 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  42.06 
 
 
452 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  39.47 
 
 
498 aa  298  2e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  42.09 
 
 
456 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  39.14 
 
 
459 aa  296  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  43.92 
 
 
456 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  40.42 
 
 
453 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  41.61 
 
 
452 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  40.42 
 
 
453 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  37.55 
 
 
502 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  41.09 
 
 
452 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1016  amino acid carrier protein  37.58 
 
 
471 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.190269  normal  0.164712 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  38.12 
 
 
460 aa  292  8e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  41.61 
 
 
452 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  41.61 
 
 
452 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  41.61 
 
 
452 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  41.83 
 
 
452 aa  292  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  40.46 
 
 
447 aa  292  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  38.9 
 
 
476 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  42.32 
 
 
457 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  39.47 
 
 
477 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  40.52 
 
 
455 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  42.79 
 
 
458 aa  290  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  39.22 
 
 
457 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  38.43 
 
 
477 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  37.5 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  42.6 
 
 
450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  43.74 
 
 
471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  40.52 
 
 
476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  38.49 
 
 
492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  37.81 
 
 
474 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  38.11 
 
 
443 aa  282  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  39.47 
 
 
458 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>