166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0053 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
99 aa  190  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
102 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  50.6 
 
 
96 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  54.79 
 
 
99 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  54.32 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  43.9 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  42.39 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  60.81 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  60.81 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  54.79 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  55.74 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  46.25 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  49.33 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  62.26 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  52.17 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  60.34 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  60.34 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  51.61 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  51.61 
 
 
96 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  51.61 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  60.34 
 
 
96 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  53.57 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  43.9 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  39.51 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  41.38 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  42.68 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  36.49 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  45.16 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  47.44 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  35.14 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  43.28 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  52.63 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  41.54 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  40.45 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2660  hypothetical protein  40.74 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  39.33 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  39.33 
 
 
196 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  38.2 
 
 
196 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  37.18 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  44.44 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0891  YGGT family protein  37.35 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0499141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  36.84 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  39.24 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  34.09 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  39.51 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  30.69 
 
 
196 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  48.1  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  34.57 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  38.16 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 
184 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1125  protein of unknown function YGGT  41.54 
 
 
182 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000165213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  45.16 
 
 
182 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  31.76 
 
 
85 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  55.56 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  43.55 
 
 
182 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  39.44 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  35.96 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  37.8 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4497  protein of unknown function YGGT  38.98 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  40.91 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  43.55 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0758  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4433  protein of unknown function YGGT  38.98 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  35.06 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  35.06 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  32.88 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  40.32 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  41.94 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1135  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000824226  normal  0.525534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  35.96 
 
 
197 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  61.11 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0773  protein of unknown function YGGT  38.03 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.148544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  38.37 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  37.84 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0541  membrane protein, related to K+ transport  34.72 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36 
 
 
92 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  32.58 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>