44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0041 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0041  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3567  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.63 
 
 		 734 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0119  uroporphyrinogen III synthase HEM4  40.51 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1350  uroporphyrinogen III synthase HEM4  39.24 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0706582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1159  uroporphyrinogen III synthase HEM4  38.4 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1000  uroporphyrinogen-III synthase, putative  26.72 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0374763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0047  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0257  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0472  uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.93 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.850849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0563  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.27 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0469  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.54 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0288  putative uroporphyrinogen-III synthase  33.05 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0314  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.53 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  0.471144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0546  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.03 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0290  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.583848  normal  0.971702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0733  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.81 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1814  uroporphyrinogen-III synthase  29.24 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1886  uroporphyrinogen-III synthase  29.24 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3416  uroporphyrinogen-III synthase  33.52 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0747  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.47 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4534  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.19 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4324  hypothetical protein  27.47 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0706  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.827185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3201  uroporphyrinogen-III synthase  31.62 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0006  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.07 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3700  uroporphyrinogen-III synthase  32.23 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1937  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.46 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0356015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2070  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.4 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239723  normal  0.0510209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4468  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.33 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0008  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.66 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000296597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0127  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.91 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0976  uroporphyrinogen-III synthase  32.47 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2967  uroporphyrinogen-III synthase  32.38 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4021  uroporphyrinogen-III synthase  31.38 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0948  uroporphyrinogen-III synthase  27.78 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4146  uroporphyrinogen-III synthase  27.75 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373106  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1262  uroporphyrinogen-III synthase  29.46 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4081  uroporphyrinogen-III synthase, putative  30.56 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2828  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.69 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0185  uroporphyrinogen-III synthase  27 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0736  uroporphyrinogen-III synthase  30.4 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1997  putative uroporphyrinogen-III synthase  34.27 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.63 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.01 
 
 		 508 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>