More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0040 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0040  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 321 aa  634    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  49.35 
 
 		 322 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  49.03 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  55.8 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  47.48 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  52.01 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  45.14 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  53.48 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 318 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  53.11 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  47.6 
 
 		 318 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  46.88 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  49.19 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  48.89 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  51.1 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  46.65 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1349  porphobilinogen deaminase  51.48 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  46.33 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  54.68 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  50.74 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  45.74 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  48.91 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  45.82 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  48.2 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 309 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  43.97 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  49.1 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  46.01 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  45.49 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  44.13 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  51.98 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  51 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2179  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230446  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  44.07 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  46.55 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  44.51 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 308 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  45.36 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  46.84 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  45.05 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  47.48 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  45.23 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  44.64 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  46.89 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  45.33 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  49.22 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  43.77 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1936  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0833928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  47.06 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  44.97 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  43.9 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1069  porphobilinogen deaminase  47.67 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  45.09 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  45.68 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  42.26 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  45.17 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  49.24 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  46.51 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  44.29 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  45.68 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  48.24 
 
 		 313 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  45.82 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  42.72 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  47.84 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  42.41 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  44.96 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  45.39 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  42.41 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  45.31 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.25 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>