More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0019 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 294 aa  594  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  47.08 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  47.39 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  45.52 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  45.79 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  45.79 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  46.67 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  47.13 
 
 		 278 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  42.42 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  46.36 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  44.23 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  47.04 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  41.42 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  46.92 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  43.08 
 
 		 280 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  41.95 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  40.44 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  40.81 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  37.35 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  44.74 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  42.64 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  39.69 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  38.76 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1859  diaminopimelate epimerase  42.26 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1932  diaminopimelate epimerase  42.26 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  42.54 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3748  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4071  diaminopimelate epimerase  40.52 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  41.58 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  40.53 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  40.3 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  43.4 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0927  diaminopimelate epimerase  42.64 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.43 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.72 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.92 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  38.83 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  41.13 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  40.64 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 277 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  39.25 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3391  diaminopimelate epimerase  40.38 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 286 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.47 
 
 		 297 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.47 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  39.92 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0019  diaminopimelate epimerase  40.82 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.97 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  41.13 
 
 		 292 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  34.96 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  37.17 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  36.12 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  42.97 
 
 		 276 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  38.4 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.24 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4198  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.4 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>