More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_23250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  72.35 
 
 
177 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  83.61 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  81.15 
 
 
175 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  80.33 
 
 
219 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  61.08 
 
 
192 aa  208  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  81.51 
 
 
173 aa  207  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  78.05 
 
 
159 aa  206  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  55.76 
 
 
188 aa  205  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  76.42 
 
 
170 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  79.51 
 
 
193 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  79.67 
 
 
189 aa  204  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  77.05 
 
 
193 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  69.93 
 
 
156 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  78.69 
 
 
186 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  77.05 
 
 
166 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  76.23 
 
 
188 aa  201  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  62.5 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  53.69 
 
 
300 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  75.41 
 
 
189 aa  198  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  75.83 
 
 
164 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  62.73 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  72.95 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  75.63 
 
 
172 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  63.76 
 
 
153 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  75.41 
 
 
195 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  73.77 
 
 
168 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  69.05 
 
 
166 aa  188  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  65.28 
 
 
171 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  73.98 
 
 
170 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  69.11 
 
 
167 aa  184  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  73.55 
 
 
170 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  69.11 
 
 
169 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  70 
 
 
163 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  63.31 
 
 
218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  75.41 
 
 
182 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  70 
 
 
171 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  68.6 
 
 
191 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  64.34 
 
 
193 aa  175  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 
179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  61.29 
 
 
179 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  42.65 
 
 
167 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  54.7 
 
 
148 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  60.16 
 
 
201 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  42.58 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  53.39 
 
 
179 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  46.72 
 
 
305 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  45.45 
 
 
148 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  43.59 
 
 
174 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.43 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.43 
 
 
173 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.87 
 
 
173 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  36.31 
 
 
169 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  36.31 
 
 
170 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  44.8 
 
 
164 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.6 
 
 
164 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  36.31 
 
 
164 aa  92.8  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  43.44 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  42.06 
 
 
118 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.91 
 
 
172 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  40.15 
 
 
137 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  44 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  36.59 
 
 
233 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  45.37 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  34.48 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  45.37 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  42.45 
 
 
172 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  33.79 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  34.9 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.51 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  38.06 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  42.45 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  33.96 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.32 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  38.3 
 
 
156 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  45 
 
 
169 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  40.59 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  38.68 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  42.06 
 
 
150 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34.25 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  41 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  34.25 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  34.25 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  34.25 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  33.14 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  39.09 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  33.53 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  29.9 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  35.51 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  44 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  42.45 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>