More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_22200 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  584  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  56.22 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  50 
 
 
261 aa  225  6e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  52.31 
 
 
247 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  55.08 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  49.75 
 
 
249 aa  210  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  49 
 
 
277 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  46.15 
 
 
274 aa  199  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  47.96 
 
 
239 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  46.83 
 
 
271 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  44.85 
 
 
313 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  50 
 
 
204 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  43.41 
 
 
216 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  42.31 
 
 
216 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  42.31 
 
 
216 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  41.15 
 
 
230 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  42.86 
 
 
216 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  39.9 
 
 
216 aa  165  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  44.28 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  38.21 
 
 
269 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  43.32 
 
 
229 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  39.5 
 
 
224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  41.03 
 
 
246 aa  153  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  38.69 
 
 
208 aa  152  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  37.31 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  37.24 
 
 
217 aa  146  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  33.67 
 
 
233 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  36.82 
 
 
215 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  36.82 
 
 
212 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  38.95 
 
 
226 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  38.25 
 
 
247 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  37.97 
 
 
263 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  37.97 
 
 
263 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  36.32 
 
 
212 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  33.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  33.62 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  37.97 
 
 
210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  37.43 
 
 
212 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  37.44 
 
 
224 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  37.43 
 
 
223 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  37.37 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  37.37 
 
 
211 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  37.37 
 
 
211 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  35.48 
 
 
191 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  37.01 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  35.76 
 
 
203 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  31.93 
 
 
208 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  31.88 
 
 
221 aa  89  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0645  GTP pyrophosphokinase (ATP:GTP 3'-pyrophosphotransferase)(ppGpp synthetase I) ((P)ppGpp synthetase)  28.35 
 
 
750 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0652  RelA/SpoT family protein  28.35 
 
 
750 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  26.88 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2058  RelA/SpoT domain-containing protein  23.63 
 
 
542 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.25764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  29.07 
 
 
705 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.07 
 
 
705 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0946  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.61 
 
 
745 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0514  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.19 
 
 
722 aa  57  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.49 
 
 
705 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1146  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.71 
 
 
717 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144176  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1575  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.78 
 
 
743 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145975  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.14 
 
 
736 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0343  putative RelA/SpoT family protein  35.43 
 
 
846 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000094604  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0377  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  35.43 
 
 
846 aa  56.2  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000730209  normal  0.0150948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  31.82 
 
 
381 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2496  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.09 
 
 
747 aa  55.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2856  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.57 
 
 
749 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0013983  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3149  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.09 
 
 
747 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0194  GTP pyrophosphokinase  35.19 
 
 
714 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0468  GTP pyrophosphokinase  31.01 
 
 
742 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.135158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  27.93 
 
 
366 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1728  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.4 
 
 
705 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0998  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.82 
 
 
736 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  33.86 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2636  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  26.8 
 
 
748 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.43 
 
 
362 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  28.86 
 
 
570 aa  53.1  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2565  metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
710 aa  52.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00145552  hitchhiker  0.00000902572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  32.81 
 
 
749 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3548  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.01 
 
 
745 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000488354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3389  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.01 
 
 
744 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  33.9 
 
 
759 aa  52.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0383  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.59 
 
 
897 aa  52.4  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000110921  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1588  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  36.19 
 
 
753 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.870499  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0815  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.01 
 
 
745 aa  52.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3877  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.91 
 
 
742 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1576  GTP pyrophosphokinase  31.9 
 
 
746 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1648  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.33 
 
 
741 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0787569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1978  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.33 
 
 
741 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.699321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>