15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20950 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20950    100 
 
 
351 bp  696    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.440938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  80.72 
 
 
957 bp  113  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  87.38 
 
 
1446 bp  101  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00970    80.88 
 
 
231 bp  95.6  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  84.82 
 
 
1269 bp  87.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20180    87.65 
 
 
3818 bp  81.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0720363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0685    83.87 
 
 
992 bp  65.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  83.16 
 
 
999 bp  61.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  83.16 
 
 
999 bp  61.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 
1077 bp  60  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 
1077 bp  60  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 
1077 bp  60  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 
1077 bp  60  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  79.87 
 
 
1077 bp  60  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15100    89.36 
 
 
1065 bp  54  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>