More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20700 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  100 
 
 
395 aa  805    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  98.08 
 
 
312 aa  627  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  70.47 
 
 
364 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  70.47 
 
 
364 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  70.5 
 
 
344 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  71.65 
 
 
323 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  54.47 
 
 
367 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  42.5 
 
 
373 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  36.89 
 
 
361 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  37.5 
 
 
372 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  36.87 
 
 
361 aa  229  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  33.04 
 
 
370 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  32.97 
 
 
384 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  69.78 
 
 
141 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  34.9 
 
 
519 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  35.01 
 
 
388 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  35.01 
 
 
388 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  35.01 
 
 
388 aa  176  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  34.43 
 
 
399 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  34.35 
 
 
401 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  34.43 
 
 
399 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  34.43 
 
 
399 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  35.46 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  35.46 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  35.46 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  35.46 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  34.28 
 
 
393 aa  146  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  30.54 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.23 
 
 
295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3611  integrase domain protein SAM domain protein  28.73 
 
 
399 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00442535  normal  0.0137307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  29.69 
 
 
324 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  29.69 
 
 
324 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  29.69 
 
 
324 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.4 
 
 
295 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  24.86 
 
 
364 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5285  phage integrase family protein  32.65 
 
 
388 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  35.14 
 
 
286 aa  99.8  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  30.15 
 
 
320 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  29.06 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  29.06 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  29.24 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  28.16 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.68 
 
 
295 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.83 
 
 
290 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4792  phage integrase family protein  27.22 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2265  phage integrase family protein  27.22 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2972  phage integrase family protein  27.22 
 
 
411 aa  93.6  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  29.01 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  29.01 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  29.01 
 
 
349 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  25.97 
 
 
282 aa  93.2  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  32.83 
 
 
302 aa  92.8  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  24.25 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 
296 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  28.19 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 
302 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.95 
 
 
299 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  26.71 
 
 
291 aa  90.1  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  24.78 
 
 
297 aa  89.4  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 
294 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.2 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  31.12 
 
 
291 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  26.11 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  25.28 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.25 
 
 
298 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  28.4 
 
 
297 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  28.53 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  27.81 
 
 
400 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.48 
 
 
321 aa  87  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  27.42 
 
 
314 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  25.8 
 
 
305 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 
319 aa  86.3  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  23.65 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  24.85 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  32.98 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.47 
 
 
297 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.63 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  26.65 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.32 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>