More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_17000 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_17000  SSU ribosomal protein S5P  100 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000450138  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  81.61 
 
 
236 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  80.81 
 
 
238 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  78.31 
 
 
202 aa  264  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  78.31 
 
 
202 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  78.18 
 
 
205 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  73.89 
 
 
200 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  78.31 
 
 
210 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  75.9 
 
 
210 aa  255  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  75 
 
 
205 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  73.45 
 
 
200 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  76.65 
 
 
199 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  73.81 
 
 
220 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  73.78 
 
 
223 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  73.78 
 
 
223 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  73.78 
 
 
223 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  74.55 
 
 
222 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 
225 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0644  ribosomal protein S5  82.04 
 
 
218 aa  245  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.883982  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  73.05 
 
 
215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  75.15 
 
 
208 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2642  ribosomal protein S5  80.81 
 
 
214 aa  241  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23630  SSU ribosomal protein S5P  69.38 
 
 
227 aa  241  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1724  30S ribosomal protein S5  73.62 
 
 
243 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00276041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0604  ribosomal protein S5  69.63 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.221884  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1140  ribosomal protein S5  78.79 
 
 
210 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.5558  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3126  ribosomal protein S5  76.7 
 
 
226 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4298  30S ribosomal protein S5  75.42 
 
 
204 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3906  30S ribosomal protein S5  75.42 
 
 
204 aa  235  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497899  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04150  30S ribosomal protein S5  80.47 
 
 
209 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  65.4 
 
 
215 aa  229  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  70.19 
 
 
233 aa  229  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4490  ribosomal protein S5  77.84 
 
 
204 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20700  SSU ribosomal protein S5P  79.75 
 
 
232 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.950879  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6597  30S ribosomal protein S5  79.52 
 
 
201 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29570  SSU ribosomal protein S5P  70.24 
 
 
223 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.219662  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0705  ribosomal protein S5  76.51 
 
 
218 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0948  ribosomal protein S5  73.29 
 
 
212 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.10743  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  62.5 
 
 
166 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.38 
 
 
166 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  60.49 
 
 
166 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.58 
 
 
168 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  61.25 
 
 
164 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  65.79 
 
 
197 aa  188  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
167 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000490298  decreased coverage  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
167 aa  188  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0217  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  hitchhiker  0.000109901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4153  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000035229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4039  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000362616  unclonable  0.0000000000030102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0213  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000121956  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  60.62 
 
 
166 aa  188  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
167 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
166 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
167 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
167 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
167 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  61.88 
 
 
166 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  58.02 
 
 
183 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  59.49 
 
 
168 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  56.52 
 
 
166 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  60.76 
 
 
173 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
167 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  54.66 
 
 
169 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
166 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  63.16 
 
 
166 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  61.25 
 
 
166 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  63.46 
 
 
167 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 
168 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  58.13 
 
 
168 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  56.4 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  60 
 
 
166 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  55.42 
 
 
173 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 
166 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  57.56 
 
 
189 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 
166 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60.12 
 
 
182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  62.67 
 
 
166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
166 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0410  ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0410  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000646681  hitchhiker  0.00000284656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3619  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0273199  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3692  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0779682  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3688  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3790  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234503  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  54.37 
 
 
167 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>