More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_16720 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  100 
 
 
401 aa  771    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  55.36 
 
 
437 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  54.96 
 
 
417 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  49.01 
 
 
397 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  47.41 
 
 
384 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  48.85 
 
 
402 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  45.95 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  45.95 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  45.95 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  49.14 
 
 
380 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  48.7 
 
 
405 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  46.04 
 
 
381 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  45.65 
 
 
408 aa  259  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.15 
 
 
373 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  47.41 
 
 
378 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  47.33 
 
 
412 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  50 
 
 
375 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.84 
 
 
373 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  43.12 
 
 
410 aa  255  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  48.97 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  48.7 
 
 
378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  47.83 
 
 
410 aa  254  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.15 
 
 
373 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  42.68 
 
 
402 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  47.63 
 
 
383 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  47.31 
 
 
388 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  47.23 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  47.38 
 
 
376 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  46.05 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  45.93 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  46.05 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  46.88 
 
 
378 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  49.87 
 
 
378 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.66 
 
 
380 aa  243  5e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  45.69 
 
 
415 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  45.93 
 
 
441 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  40.96 
 
 
370 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  46.58 
 
 
381 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  43.5 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  46.7 
 
 
390 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  40.19 
 
 
459 aa  232  9e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  42.18 
 
 
366 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  37.8 
 
 
390 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  39.21 
 
 
373 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  41.16 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.48 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  46.84 
 
 
394 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  35.92 
 
 
391 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  35.23 
 
 
391 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  34.97 
 
 
391 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  35.23 
 
 
391 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  34.97 
 
 
391 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  34.97 
 
 
391 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  40.26 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  35.23 
 
 
391 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  36.15 
 
 
389 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  34.63 
 
 
392 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  45.36 
 
 
380 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  40.45 
 
 
390 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.41 
 
 
389 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.83 
 
 
391 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.63 
 
 
391 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  38.67 
 
 
375 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.53 
 
 
369 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0383  alanine racemase  39.16 
 
 
358 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  38.67 
 
 
366 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  34.88 
 
 
391 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  41.16 
 
 
373 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  36.05 
 
 
377 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  39.79 
 
 
375 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002338  alanine racemase biosynthetic  38.93 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00173731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  41.69 
 
 
394 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  37.75 
 
 
450 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  34.37 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0708  alanine racemase  38.3 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.33 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  32.58 
 
 
399 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  31.92 
 
 
399 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.18 
 
 
395 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.3 
 
 
388 aa  196  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4448  alanine racemase  38.03 
 
 
359 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418216  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  38.28 
 
 
358 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  38.05 
 
 
388 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  37.6 
 
 
358 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0257  alanine racemase  38.16 
 
 
359 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533775  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03925  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.190319  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3940  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4293  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3975  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4514  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03885  hypothetical protein  38.68 
 
 
359 aa  192  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  34.38 
 
 
390 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3499  alanine racemase  38.95 
 
 
360 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  38.13 
 
 
358 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  32.82 
 
 
402 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  33.16 
 
 
402 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4542  alanine racemase  38.68 
 
 
359 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5555  alanine racemase  38.16 
 
 
359 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  38.27 
 
 
434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  40.31 
 
 
380 aa  190  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>