More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13710 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  100 
 
 		 431 aa  823    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  48.85 
 
 		 408 aa  332  9e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  47.34 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  48.6 
 
 		 410 aa  318  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  48.5 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  49 
 
 		 422 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  47.46 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  45.66 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  47.61 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  46.65 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  47.15 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.55 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  46.02 
 
 		 420 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  45.23 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  43.97 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  45.18 
 
 		 410 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  46.19 
 
 		 415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10700  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.87 
 
 		 422 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00310871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  39.27 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  44.7 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  43.69 
 
 		 424 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  43.26 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  41.16 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  35.66 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  43.38 
 
 		 413 aa  249  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  42.64 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  43.52 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  36.99 
 
 		 384 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 		 397 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  42.94 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  36.98 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  41.95 
 
 		 413 aa  236  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 418 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  42.65 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  35.98 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  33.25 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  33.75 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  41.49 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  42.02 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  43.01 
 
 		 418 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  40.29 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  39.34 
 
 		 428 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  38 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  34.31 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.26 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  41.44 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  36.66 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  42.35 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.6 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  40.9 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 368 aa  222  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  36.71 
 
 		 426 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  31.59 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 375 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  32.34 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  38.04 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 358 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4749  DNA polymerase IV  36.8 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 		 372 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  40.48 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  39.05 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  34.27 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3002  DNA-directed DNA polymerase  43.13 
 
 		 449 aa  212  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  39.87 
 
 		 365 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  34.37 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  36.18 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  41.62 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1021  DNA polymerase IV  40.1 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.6656  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6871  DNA-directed DNA polymerase  35.4 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  38.32 
 
 		 396 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  42.37 
 
 		 374 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  39.17 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  34.02 
 
 		 359 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  34.44 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3784  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 352 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.466948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.03 
 
 		 378 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.03 
 
 		 378 aa  210  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 355 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.8 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  34.44 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.78 
 
 		 380 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  36.32 
 
 		 431 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  38.35 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  30.92 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  38.64 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1679  DNA polymerase IV  33 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.452401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  34.29 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>