More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11980 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  50.77 
 
 
953 aa  835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  50.26 
 
 
918 aa  844    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.26 
 
 
981 aa  876    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  50 
 
 
916 aa  827    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.62 
 
 
921 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.14 
 
 
947 aa  829    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.9 
 
 
933 aa  811    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  50.21 
 
 
904 aa  855    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  51.12 
 
 
972 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.24 
 
 
950 aa  840    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.8 
 
 
950 aa  845    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  53.13 
 
 
952 aa  851    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.07 
 
 
918 aa  798    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.24 
 
 
984 aa  1028    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.7 
 
 
964 aa  1025    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  100 
 
 
994 aa  1985    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  52.45 
 
 
906 aa  855    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.1 
 
 
951 aa  771    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  51.48 
 
 
936 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  48.28 
 
 
906 aa  788    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 
918 aa  798    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.23 
 
 
996 aa  795    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.99 
 
 
929 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.2 
 
 
917 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.66 
 
 
932 aa  723    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  50.31 
 
 
909 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.97 
 
 
918 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
931 aa  578  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.27 
 
 
951 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
922 aa  544  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  49.35 
 
 
863 aa  541  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.84 
 
 
877 aa  542  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  47.68 
 
 
935 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.73 
 
 
990 aa  526  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  46.5 
 
 
1026 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  46.07 
 
 
940 aa  492  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.26 
 
 
919 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.17 
 
 
961 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.6 
 
 
952 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  32.86 
 
 
924 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  32.96 
 
 
926 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  31.32 
 
 
924 aa  366  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.94 
 
 
889 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  29.01 
 
 
908 aa  362  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.47 
 
 
919 aa  355  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  28.92 
 
 
1239 aa  344  4e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  28.96 
 
 
967 aa  342  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  28.86 
 
 
967 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  37.21 
 
 
1055 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  38.73 
 
 
1185 aa  325  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  33.11 
 
 
1068 aa  293  9e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 
709 aa  249  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.67 
 
 
815 aa  231  5e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  55.68 
 
 
924 aa  218  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  48.33 
 
 
893 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  52.17 
 
 
908 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  50.5 
 
 
927 aa  212  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  50.5 
 
 
927 aa  212  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  52.17 
 
 
908 aa  211  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  51.24 
 
 
890 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  51.09 
 
 
908 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  49.01 
 
 
905 aa  201  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  47.66 
 
 
1293 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  53.37 
 
 
872 aa  197  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  45.66 
 
 
1003 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  33.66 
 
 
1209 aa  188  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  50.26 
 
 
1175 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  44.19 
 
 
1068 aa  177  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  45.5 
 
 
1073 aa  177  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.74 
 
 
424 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  46.07 
 
 
933 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  42.92 
 
 
998 aa  175  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.8 
 
 
762 aa  174  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.83 
 
 
843 aa  155  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  34.07 
 
 
1023 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.75 
 
 
838 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.18 
 
 
848 aa  138  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
835 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.93 
 
 
832 aa  135  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.12 
 
 
710 aa  135  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  41.71 
 
 
830 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  38.05 
 
 
891 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.02 
 
 
837 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.92 
 
 
832 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.89 
 
 
847 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.49 
 
 
827 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.46 
 
 
873 aa  131  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.19 
 
 
950 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.32 
 
 
1231 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  40.41 
 
 
861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  44.44 
 
 
885 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.57 
 
 
861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.57 
 
 
861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
837 aa  129  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.4 
 
 
876 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  40.1 
 
 
842 aa  129  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.1 
 
 
817 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
836 aa  128  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  38.86 
 
 
869 aa  128  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.19 
 
 
847 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>