More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10790 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  100 
 
 
191 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  50.27 
 
 
204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  50.28 
 
 
197 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  54.04 
 
 
186 aa  167  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  54.04 
 
 
186 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  52.53 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  50.93 
 
 
183 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  53.42 
 
 
180 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  49.69 
 
 
181 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.37 
 
 
167 aa  151  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  50.31 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.66 
 
 
168 aa  150  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  50.63 
 
 
164 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  47.2 
 
 
166 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  51.76 
 
 
195 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  50.31 
 
 
182 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  50.93 
 
 
181 aa  147  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  48.15 
 
 
183 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  47.2 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  50 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  51.23 
 
 
162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  47.2 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  48.43 
 
 
162 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  50.88 
 
 
183 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  45.96 
 
 
162 aa  142  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  43.75 
 
 
230 aa  141  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  45.9 
 
 
185 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  48.3 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  48.43 
 
 
162 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  49.37 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  48 
 
 
197 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  48 
 
 
197 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  48 
 
 
197 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  48.3 
 
 
197 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  52.47 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  46.54 
 
 
162 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  48.28 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  44.17 
 
 
162 aa  134  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  51.45 
 
 
182 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  52.05 
 
 
162 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.85 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  47.16 
 
 
197 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  49.34 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  48.8 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  48.72 
 
 
164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  49.71 
 
 
190 aa  127  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  47.83 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  41.67 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  45.98 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  40.49 
 
 
171 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  41.25 
 
 
168 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  40.36 
 
 
174 aa  124  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  50.97 
 
 
190 aa  124  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  51.37 
 
 
219 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  46.24 
 
 
230 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.88 
 
 
168 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  47.68 
 
 
159 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.25 
 
 
168 aa  121  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.62 
 
 
168 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.75 
 
 
163 aa  120  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  50 
 
 
199 aa  120  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  50.99 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40.62 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.09 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  44.72 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  51.11 
 
 
225 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  52.74 
 
 
177 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  43.2 
 
 
213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  40.62 
 
 
168 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.14 
 
 
167 aa  118  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.81 
 
 
227 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  42.77 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  44.85 
 
 
169 aa  117  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.83 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  42.48 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.24 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.24 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.62 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0873  N-formylmethionyl tRNA deformylase  46.58 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  38.46 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  40.35 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  42.29 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.62 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  40.72 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  43.83 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  43.21 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.92 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  40.48 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.77 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.88 
 
 
215 aa  115  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.78 
 
 
187 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.78 
 
 
187 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  43.21 
 
 
185 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  47.27 
 
 
200 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.94 
 
 
178 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.38 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  44.31 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  43.59 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.65 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  42.14 
 
 
170 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>