100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10750 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10750  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216656  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0041  tRNA-Val  98.61 
 
 
72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.532077  normal  0.0646966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13840  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13890  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0287375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0038  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16760  tRNA-Val  98.51 
 
 
72 bp  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268589  normal  0.0588163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0035  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0033  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.526612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16730  tRNA-Val  98.51 
 
 
72 bp  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251043  normal  0.0595565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0031  tRNA-Val  98.51 
 
 
72 bp  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000451767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0033  tRNA-Val  98.51 
 
 
72 bp  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000837062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0029  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0028  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0032  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.463355  normal  0.0505941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0036  tRNA-Val  98.51 
 
 
75 bp  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15510  tRNA-Val  95.52 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00141573  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0037  tRNA-Val  95.52 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0044  tRNA-Val  95.52 
 
 
75 bp  109  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.311014  normal  0.10516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0028  tRNA-Val  94.03 
 
 
72 bp  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0026  tRNA-Val  94.03 
 
 
75 bp  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13860  tRNA-Val  94.03 
 
 
72 bp  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0312518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0029  tRNA-Val  94.03 
 
 
72 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.575368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0027  tRNA-Val  94.03 
 
 
75 bp  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.60657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14034  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622318  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0014  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0015  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0817161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0046  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467185  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0014  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591193  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0018  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0033  tRNA-Val  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16810  tRNA-Val  92.54 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.606714  normal  0.0176901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0040  tRNA-Val  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.90959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0038  tRNA-Val  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0036  tRNA-Val  92.54 
 
 
75 bp  93.7  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0021  tRNA-Val  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0036  tRNA-Val  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0258762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0026  tRNA-Val  91.04 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0265977  hitchhiker  0.000432959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0036  tRNA-Val  91.04 
 
 
72 bp  85.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.821341  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14860  tRNA-Val  88.89 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303289  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0033  tRNA-Val  89.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  93.62 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07570  tRNA-Val  90.91 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.10137  normal  0.977811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0039  tRNA-Val  88.06 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00107403  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0046  tRNA-Val  88.06 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.146675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0024  tRNA-Val  88.06 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0028  tRNA-Val  88.06 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.13979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0016  tRNA-Val  88.06 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1385  tRNA-Val  88.89 
 
 
72 bp  69.9  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0561605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0047  tRNA-Val  87.69 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00873766  hitchhiker  0.00896999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0043  tRNA-Val  87.69 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0177605  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0040  tRNA-Val  87.69 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288253  hitchhiker  0.000507453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0044  tRNA-Val  97.22 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403684  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0027  tRNA-Val  90.38 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000730329  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0008  tRNA-Val  90.38 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000957098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0041  tRNA-Val  91.49 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000505895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0042  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153066  hitchhiker  0.00834851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0031  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0032  tRNA-Val  91.49 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0037  tRNA-Val  86.57 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  normal  0.0810888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0026  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0408746  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0029  tRNA-Val  91.49 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0245746  normal  0.0651884 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0013  tRNA-Val  86.57 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14900  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0030  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0029  tRNA-Val  86.57 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.742373  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0014  tRNA-Val  86.57 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0032  tRNA-Val  86.57 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0029  tRNA-Val  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198673  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0060  tRNA-Val  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000546078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0031  tRNA-Val  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000478109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0052  tRNA-Val  85.07 
 
 
75 bp  54  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886993  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0021  tRNA-Val  89.36 
 
 
72 bp  54  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0026  tRNA-Val  89.36 
 
 
75 bp  54  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179113  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0037  tRNA-Val  89.36 
 
 
75 bp  54  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605152  normal  0.0106326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0029  tRNA-Val  89.36 
 
 
75 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0030  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000000857099  normal  0.523891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0002  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.264825  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  100 
 
 
81 bp  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0025  tRNA-Val  91.67 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057008  normal  0.409519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0023  tRNA-Val  91.67 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720893  normal  0.0127386 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0046  tRNA-Ala  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.150337  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0017  tRNA-Ala  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0003  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.401069  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07210  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.87743 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0018  tRNA-Val  83.58 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.347531  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309212  tRNA-Val  83.58 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.430818  normal  0.748874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0047  tRNA-Val  83.58 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0025  tRNA-Val  83.58 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000640058  normal  0.0750081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0033  tRNA-Val  87.23 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523176  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  91.43 
 
 
78 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0025  tRNA-Val  88.37 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.962727  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0035  tRNA-Val  100 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0205002  normal  0.0343396 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1386  tRNA-Val  87.04 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0550643 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309132  tRNA-Val  96.15 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  96.15 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18170  tRNA-Ala  88.1 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251001  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2794  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  44.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>