More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10660 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  45.32 
 
 
1260 aa  822    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  59.21 
 
 
1161 aa  1281    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  46.44 
 
 
1155 aa  882    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  47.14 
 
 
1320 aa  902    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  46.76 
 
 
1268 aa  873    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  45.72 
 
 
1152 aa  778    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  59.08 
 
 
1166 aa  1261    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  100 
 
 
1232 aa  2451    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4598  DNA polymerase III, alpha subunit  48.86 
 
 
1280 aa  486  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.744008  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1009  DNA polymerase III, alpha subunit  32 
 
 
1039 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0533804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.58 
 
 
1134 aa  423  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  30.69 
 
 
1156 aa  416  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  32.24 
 
 
1090 aa  416  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  28.55 
 
 
1225 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  28.76 
 
 
1145 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  30.11 
 
 
1075 aa  406  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  30.04 
 
 
1139 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1176  DNA polymerase III, alpha subunit  30.09 
 
 
1162 aa  399  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  30.8 
 
 
1182 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  31.54 
 
 
1092 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1922  DNA polymerase III, alpha subunit  32.51 
 
 
1084 aa  393  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14397  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  27.84 
 
 
1170 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1489  DNA polymerase III, alpha subunit  28.42 
 
 
1143 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1426  DNA polymerase III alpha subunit  28.42 
 
 
1143 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1242  DNA polymerase III, alpha subunit  28.33 
 
 
1170 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  29.41 
 
 
1033 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  31.72 
 
 
1087 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1177  DNA polymerase III, alpha subunit  30.65 
 
 
1167 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.906306  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  30.27 
 
 
1059 aa  390  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  26.38 
 
 
1127 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1461  DNA polymerase III, alpha subunit  30.65 
 
 
1166 aa  389  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  30.5 
 
 
1026 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  28.02 
 
 
1170 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  28.78 
 
 
1132 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  30.69 
 
 
1026 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  30.38 
 
 
1059 aa  385  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  30.56 
 
 
1183 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  31.54 
 
 
1026 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  30.91 
 
 
1026 aa  383  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.791308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  27.78 
 
 
1157 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  31.01 
 
 
1090 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  29.5 
 
 
1053 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  30.67 
 
 
1099 aa  383  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  30.67 
 
 
1099 aa  383  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  27.13 
 
 
1158 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  30.67 
 
 
1099 aa  383  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  28.53 
 
 
1165 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  27.89 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 
1158 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  27.3 
 
 
1122 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  380  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  28.06 
 
 
1160 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  28.15 
 
 
1160 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  33.07 
 
 
1024 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  28.15 
 
 
1160 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  30.52 
 
 
1194 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  30.46 
 
 
1031 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  30.45 
 
 
1049 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  27.18 
 
 
1159 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  27.68 
 
 
1160 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  29.19 
 
 
1082 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  29.72 
 
 
1087 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  29.24 
 
 
1070 aa  372  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  31.04 
 
 
1075 aa  373  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  26.54 
 
 
1158 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  30.69 
 
 
1124 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  27.13 
 
 
1157 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  29.29 
 
 
1039 aa  373  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  31.03 
 
 
1026 aa  373  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  27.83 
 
 
1049 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  26.58 
 
 
1158 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  28.34 
 
 
1085 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0632  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 
1165 aa  370  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  26.22 
 
 
1145 aa  370  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  27.13 
 
 
1158 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3266  DNA polymerase III subunit alpha  27.08 
 
 
1157 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.440143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  28.55 
 
 
1168 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  28.19 
 
 
1160 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  28.19 
 
 
1043 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  26.54 
 
 
1158 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  27.92 
 
 
1076 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0130  DNA polymerase III, alpha subunit  28.79 
 
 
1173 aa  370  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  30.58 
 
 
1031 aa  370  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  30.79 
 
 
1049 aa  370  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  26.92 
 
 
1158 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  29.49 
 
 
1159 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4067  DNA polymerase III subunit alpha  27.99 
 
 
1174 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  30.1 
 
 
1026 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  28.85 
 
 
1175 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  31.31 
 
 
1044 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>