121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09490 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  100 
 
 
322 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  57.14 
 
 
378 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  64.66 
 
 
401 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  67.38 
 
 
366 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  67.97 
 
 
412 aa  159  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0254  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.49 
 
 
142 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  64.06 
 
 
363 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.29 
 
 
378 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  54.78 
 
 
452 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  57.32 
 
 
378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00670  hypothetical protein  56.25 
 
 
134 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06380  hypothetical protein  56.25 
 
 
134 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1024  hypothetical protein  56.72 
 
 
150 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47673  normal  0.0221645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30430  hypothetical protein  56.92 
 
 
136 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.154496 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  56.25 
 
 
370 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0069  hypothetical protein  57.48 
 
 
136 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.66 
 
 
382 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.68 
 
 
427 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  56.62 
 
 
440 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  52.9 
 
 
352 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  57.46 
 
 
383 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  59.54 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  55.8 
 
 
369 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1012  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.85 
 
 
138 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  59.83 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  58.59 
 
 
137 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.84 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.49 
 
 
365 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.49 
 
 
365 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.49 
 
 
365 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  52.17 
 
 
411 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1537  hypothetical protein  51.94 
 
 
148 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.24 
 
 
356 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  58.97 
 
 
402 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09050  hypothetical protein  48.51 
 
 
142 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2385  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.52 
 
 
156 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  43.31 
 
 
132 aa  90.1  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  44.19 
 
 
133 aa  89.4  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  41.6 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  41.6 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  37.41 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  40.8 
 
 
168 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  39.39 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  41.41 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  40.16 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  38.71 
 
 
198 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  39.71 
 
 
142 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  34.85 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  38.58 
 
 
142 aa  77  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  39.06 
 
 
126 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  33.85 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  34.09 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.99 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  38.89 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  36.17 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  39.53 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  35.07 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  36.8 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  35.29 
 
 
139 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  38.54 
 
 
148 aa  62.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  33.33 
 
 
209 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  36.22 
 
 
198 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  35.06 
 
 
376 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  40 
 
 
187 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  35.71 
 
 
198 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  37.5 
 
 
187 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  34.11 
 
 
128 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  32.54 
 
 
128 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  33.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  34.38 
 
 
154 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  30.77 
 
 
145 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1367  glyoxalase family protein  24.81 
 
 
127 aa  50.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  35.4 
 
 
388 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  28.67 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  29.55 
 
 
132 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  24.03 
 
 
131 aa  49.7  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  28.57 
 
 
170 aa  49.3  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  34.13 
 
 
145 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  26.21 
 
 
159 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  32.28 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  40.91 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  27.34 
 
 
2805 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  32.28 
 
 
128 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  32.5 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  22.05 
 
 
133 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  22.05 
 
 
133 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2970  lactoylglutathione lyase  25.76 
 
 
126 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  33.77 
 
 
118 aa  47.4  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3504  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.71 
 
 
127 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  34.15 
 
 
236 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  30.6 
 
 
152 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  28.36 
 
 
219 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  31.19 
 
 
176 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  34.57 
 
 
81 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>