299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03370 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03370  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0011  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0055  tRNA-Arg  92 
 
 
76 bp  93.7  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0010  tRNA-Arg  93.65 
 
 
74 bp  93.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.552541  hitchhiker  0.000550393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  93.44 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0075  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0038  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000962108  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  94.64 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0053  tRNA-Arg  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000144377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0046  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0038  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111435  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0007  tRNA-Arg  92.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  89.33 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  89.19 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0011  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.223913  normal  0.579153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  89.04 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  89.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0045  tRNA-Arg  88.41 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  89.04 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  92.31 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0037  tRNA-Arg  90.91 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  86.67 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  88.89 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0086  tRNA-Arg  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0040  tRNA-Arg  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  91.84 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  91.84 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0029  tRNA-Arg  92.31 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  90.38 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  86.67 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  86.67 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  89.83 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000753452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  91.3 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0063  tRNA-Arg  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  94.74 
 
 
1668 bp  60  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0006  tRNA-Arg  86.49 
 
 
73 bp  60  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27060  tRNA-Arg  87.72 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.14879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01900  tRNA-Arg  87.69 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.952445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26100  tRNA-Arg  87.69 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  89.47 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0005  tRNA-Arg  87.69 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0006  tRNA-Arg  87.69 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0011  tRNA-His  87.72 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  89.58 
 
 
77 bp  56  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0007  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.129572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153389  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0586  tRNA-Arg  84.72 
 
 
74 bp  56  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00782572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0008  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56031  normal  0.0314068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0018  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.574082  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0057  tRNA-Arg  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.921424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0009  tRNA-Arg  89.58 
 
 
73 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t100  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t003  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0019  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000206641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0144  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012967  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0137  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000570395  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00382598  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0133  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0125  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0119  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289401  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0144  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  54  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0778877  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  85.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0047  tRNA-Val  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00070  tRNA-Arg  87.04 
 
 
77 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0206653  normal  0.0328512 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00117786  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  90.24 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0005  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_830  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0026  tRNA-Arg  86.15 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  84.62 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>