More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01900 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  100 
 
 		 619 aa  1235    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  56.7 
 
 		 606 aa  565  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  49.16 
 
 		 637 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  51.11 
 
 		 580 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  48.83 
 
 		 573 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  47.55 
 
 		 603 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  44.09 
 
 		 642 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  43.97 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  41.44 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  42.05 
 
 		 582 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  42.59 
 
 		 581 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  43.84 
 
 		 659 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  42.59 
 
 		 581 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  44.97 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  42.21 
 
 		 582 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  40.17 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  38.77 
 
 		 583 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  41.5 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  41.32 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.03 
 
 		 637 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  40.03 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  41.32 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  43.82 
 
 		 580 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  42.91 
 
 		 661 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.69 
 
 		 657 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  40.41 
 
 		 585 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  41.16 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  41.4 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  41.88 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  42.13 
 
 		 661 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.11 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  40.67 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  43.14 
 
 		 530 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  40.65 
 
 		 532 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  39.12 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.22 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  41.28 
 
 		 529 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  37.26 
 
 		 629 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  41.38 
 
 		 490 aa  363  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  41.82 
 
 		 508 aa  362  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  39.86 
 
 		 600 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  41.97 
 
 		 498 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.53 
 
 		 681 aa  360  6e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  40.6 
 
 		 523 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  37.76 
 
 		 592 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  41.7 
 
 		 574 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  45.55 
 
 		 525 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  43.58 
 
 		 531 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  42.6 
 
 		 549 aa  355  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  38.51 
 
 		 656 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  40.95 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  41.57 
 
 		 541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  40.75 
 
 		 660 aa  352  8e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  38.26 
 
 		 550 aa  352  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  38.78 
 
 		 516 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  38.99 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  38.99 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  39.88 
 
 		 646 aa  352  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  38.99 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  40.3 
 
 		 538 aa  351  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  43.51 
 
 		 524 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  39.2 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.43 
 
 		 516 aa  350  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  38.78 
 
 		 516 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  38.78 
 
 		 516 aa  350  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  42.26 
 
 		 667 aa  349  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  41.68 
 
 		 534 aa  349  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  42.15 
 
 		 667 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  38.78 
 
 		 516 aa  349  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  42.15 
 
 		 667 aa  349  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  39.33 
 
 		 676 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  39.85 
 
 		 673 aa  348  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  42.06 
 
 		 667 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  37.97 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  39.36 
 
 		 685 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  42.41 
 
 		 539 aa  347  5e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  38.98 
 
 		 542 aa  346  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  38.85 
 
 		 682 aa  345  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  41.6 
 
 		 574 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  39.96 
 
 		 540 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  39.5 
 
 		 668 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  42.94 
 
 		 535 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  40.63 
 
 		 602 aa  345  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  41.41 
 
 		 664 aa  345  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  40.48 
 
 		 523 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  38.43 
 
 		 526 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  38.76 
 
 		 682 aa  344  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  38.53 
 
 		 681 aa  343  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  39.03 
 
 		 673 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  38.7 
 
 		 505 aa  343  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  37.52 
 
 		 602 aa  342  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  39.32 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  40.75 
 
 		 660 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 554 aa  342  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  46.1 
 
 		 546 aa  342  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  40.84 
 
 		 497 aa  342  2e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>