74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00830 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
116 aa  225  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  40.62 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  38.58 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  39.23 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  35.77 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  41.22 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  41.86 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  39.53 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  41.22 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  36.92 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  36.15 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  37.21 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  54.55 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  51.35 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  50 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  33.59 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  40.31 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  56.6 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  38.52 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  40.79 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  54.55 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  36.15 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  34.11 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  50.88 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  38.2 
 
 
156 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  45.83 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  44.9 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  48.15 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  34.41 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  30.58 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  51.06 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  43.21 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  41.18 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  39.13 
 
 
221 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  40 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  32.98 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  48.84 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  32.81 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  48.94 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  41.94 
 
 
304 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  43.86 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  41.79 
 
 
148 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  38.27 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0968  UspA domain protein  42.86 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.400355  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  36.84 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  37.35 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  36.54 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  43.94 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  38.6 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  39.58 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  36.54 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.23 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  34.21 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  38.89 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  33.33 
 
 
122 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  39.06 
 
 
162 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  35.71 
 
 
142 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  47.83 
 
 
283 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  38.46 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  37.18 
 
 
280 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  39.44 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1910  UspA domain protein  33.02 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.718457  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  39.58 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  42.31 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  38.3 
 
 
141 aa  40.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  37.33 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  36.14 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>