274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00720 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  43.75 
 
 
292 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  43.6 
 
 
293 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  42.11 
 
 
315 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  41.82 
 
 
286 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  41.64 
 
 
282 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  39.55 
 
 
306 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  35.53 
 
 
292 aa  155  9e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  39.07 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  40.87 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  39.64 
 
 
291 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  38.71 
 
 
302 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  40.15 
 
 
289 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  40.15 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  40.15 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  36.39 
 
 
359 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  38.28 
 
 
284 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  37.45 
 
 
303 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  37.21 
 
 
290 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  36 
 
 
303 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.1 
 
 
279 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0023  Rhomboid family protein  39.31 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.816086  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.63 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  33.68 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  34.83 
 
 
336 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  33.33 
 
 
306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  33.1 
 
 
303 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  33.89 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  35.21 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  30.94 
 
 
275 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  33.9 
 
 
292 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  28.62 
 
 
356 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  31.68 
 
 
381 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  45.74 
 
 
238 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  33.8 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  35.15 
 
 
376 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1388  hypothetical protein  34.44 
 
 
201 aa  95.5  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0295  Rhomboid family protein  33.33 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  34.33 
 
 
348 aa  89.7  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  33.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  29.05 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.85 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  34.85 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  33.09 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  31.65 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  36.76 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.52 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.65 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  39.84 
 
 
625 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  39.84 
 
 
625 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.84 
 
 
625 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  31.58 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.97 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  31 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4233  rhomboid-like protein  36.3 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386042  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  38.28 
 
 
625 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  31.13 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  30.46 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.57 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  38.46 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  36.23 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  38.28 
 
 
625 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  39.58 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  33.73 
 
 
225 aa  67  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.43 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  36.47 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.21 
 
 
579 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  37.06 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  30.91 
 
 
207 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  31.58 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  28.05 
 
 
285 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.79 
 
 
232 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  32.46 
 
 
261 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  29.79 
 
 
358 aa  62.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  30.61 
 
 
371 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  38.52 
 
 
360 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  37.75 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  28.95 
 
 
523 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1526  Rhomboid family protein  28.57 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  31.84 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  28.49 
 
 
205 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  27.45 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1050  Rhomboid family protein  36.69 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  32.85 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3232  protein tyrosine phosphatase  36.81 
 
 
225 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  28.64 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.92 
 
 
519 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  29.84 
 
 
541 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3383  rhomboid family protein  32.5 
 
 
234 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  42.31 
 
 
209 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  29.11 
 
 
228 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.66 
 
 
281 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  34.85 
 
 
182 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.58 
 
 
554 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  33.08 
 
 
190 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  32.33 
 
 
190 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  32.33 
 
 
190 aa  59.3  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  32.33 
 
 
190 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  32.33 
 
 
190 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  32.33 
 
 
190 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>