More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00030 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 
404 aa  788  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0004  recombination protein F  51.65 
 
 
402 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.15476e-13 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  50.9 
 
 
401 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  51.59 
 
 
377 aa  336  4e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  49.73 
 
 
380 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  49.73 
 
 
380 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  49.09 
 
 
390 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  3.32989e-05  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  49.73 
 
 
380 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0004  DNA replication and repair protein RecF  50 
 
 
391 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.74 
 
 
397 aa  317  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  50.92 
 
 
380 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  46.32 
 
 
414 aa  313  3e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.29 
 
 
381 aa  313  4e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  47.83 
 
 
399 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  50 
 
 
377 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  52.93 
 
 
379 aa  308  1e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  51.47 
 
 
371 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  50.26 
 
 
390 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  46.89 
 
 
386 aa  306  4e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  49.1 
 
 
398 aa  304  2e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.57 
 
 
399 aa  303  3e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  48.32 
 
 
390 aa  302  7e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  48.8 
 
 
377 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  48.26 
 
 
401 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  45.95 
 
 
420 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  47.21 
 
 
389 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  49.87 
 
 
376 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  1.75389e-08 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  50.54 
 
 
371 aa  296  4e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10003  recombination protein F  47.41 
 
 
385 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.42 
 
 
415 aa  293  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.51254e-07  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.1 
 
 
401 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  46.03 
 
 
378 aa  283  5e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.12 
 
 
397 aa  278  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  42.68 
 
 
414 aa  270  3e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0004  DNA replication and repair protein RecF  48.02 
 
 
485 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1434  recombinational DNA repair ATPase  34.69 
 
 
395 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  31.73 
 
 
372 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  29.04 
 
 
375 aa  197  4e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  28.88 
 
 
361 aa  196  5e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  28.88 
 
 
361 aa  196  5e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  29.59 
 
 
375 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  29.04 
 
 
375 aa  196  8e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  35.46 
 
 
371 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.04808e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  28.77 
 
 
375 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  29.59 
 
 
373 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.53 
 
 
392 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.88 
 
 
375 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.7 
 
 
386 aa  189  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  30.56 
 
 
366 aa  187  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  29.44 
 
 
370 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  29.44 
 
 
370 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  29.87 
 
 
371 aa  186  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.73 
 
 
371 aa  186  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  36.46 
 
 
398 aa  186  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0043  DNA replication and repair protein RecF  28.06 
 
 
433 aa  184  2e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  47.03 
 
 
457 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  32.79 
 
 
374 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  28.14 
 
 
374 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.64 
 
 
360 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  28.73 
 
 
374 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  30.05 
 
 
364 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  25.41 
 
 
376 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.49 
 
 
365 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  28.65 
 
 
369 aa  176  6e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  27.78 
 
 
369 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  36.99 
 
 
394 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.86 
 
 
364 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  29.27 
 
 
374 aa  169  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  29.44 
 
 
373 aa  169  7e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  36.93 
 
 
387 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  30.16 
 
 
371 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  29.2 
 
 
359 aa  166  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3722  DNA replication and repair protein RecF  34.82 
 
 
385 aa  164  2e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000891221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  32.8 
 
 
364 aa  162  8e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  32.49 
 
 
370 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  3.69508e-07  hitchhiker  1.45417e-07 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0025  DNA replication and repair protein RecF  31.64 
 
 
386 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.82 
 
 
382 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  27.71 
 
 
359 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.77 
 
 
420 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.1529e-05  hitchhiker  4.44236e-07 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.55 
 
 
372 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.84 
 
 
372 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.3 
 
 
369 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.42 
 
 
374 aa  154  3e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.61 
 
 
363 aa  152  9e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  25.88 
 
 
362 aa  152  9e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  33.54 
 
 
376 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  25 
 
 
365 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0004  DNA replication and repair protein RecF  26.27 
 
 
359 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  30.67 
 
 
390 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  29.32 
 
 
378 aa  150  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0003  DNA replication and repair protein  30.28 
 
 
363 aa  149  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0241212  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  31.65 
 
 
360 aa  148  1e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  31.99 
 
 
384 aa  148  1e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1620  recombination protein F  37.08 
 
 
358 aa  147  4e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>