More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2722 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2722  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  50 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1951  two component LuxR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142543  normal  0.70584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3131  two component LuxR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3091  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2672  LuxR family DNA-binding response regulator  46.41 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2640  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.437778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  44.98 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6075  two-component response regulator  41.26 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3314  putative two-component response regulator  44.5 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2603  two component LuxR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  36.49 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2271  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  44.44 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.55 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  34.62 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  35.1 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 218 aa  144  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.02 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 210 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  36.79 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0320  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  36.19 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  34.8 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  35.71 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  40.7 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.81 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.81 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  35.55 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.81 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.81 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 455 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  33.33 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  35.1 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  32.86 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1607  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.7 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  138  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 209 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  36.32 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  37.81 
 
 		 209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  35.12 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  38.16 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  32.86 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>