154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2694 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  100 
 
 
699 aa  1343    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  40.34 
 
 
732 aa  465  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  41.7 
 
 
712 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  38.63 
 
 
742 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.79 
 
 
812 aa  291  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  28.59 
 
 
695 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  29.96 
 
 
747 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  30.74 
 
 
748 aa  277  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  28.73 
 
 
695 aa  269  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  27.27 
 
 
703 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  31.95 
 
 
682 aa  264  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  29.29 
 
 
750 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  29.86 
 
 
748 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  29.47 
 
 
748 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  29.16 
 
 
748 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  29.56 
 
 
750 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  29.52 
 
 
741 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  26.16 
 
 
719 aa  253  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  29.29 
 
 
606 aa  250  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  29.4 
 
 
741 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  30.26 
 
 
606 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  29.78 
 
 
606 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  29.48 
 
 
606 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  28.32 
 
 
741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  27.71 
 
 
740 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  29.63 
 
 
741 aa  232  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  36.18 
 
 
893 aa  227  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  27.52 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  27.63 
 
 
789 aa  220  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  26.5 
 
 
745 aa  216  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  36.87 
 
 
696 aa  208  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.49 
 
 
797 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  40.92 
 
 
608 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  26.4 
 
 
640 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  27.64 
 
 
701 aa  200  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  27.54 
 
 
725 aa  190  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  28.41 
 
 
711 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  38.49 
 
 
607 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  33.54 
 
 
606 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  37.95 
 
 
607 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  38.08 
 
 
607 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25.15 
 
 
677 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  31.79 
 
 
606 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  31.94 
 
 
611 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  37.95 
 
 
607 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  23.64 
 
 
762 aa  172  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  34.8 
 
 
612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  32.89 
 
 
614 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  31.77 
 
 
604 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  36 
 
 
709 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  33.76 
 
 
614 aa  153  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  24.18 
 
 
617 aa  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  24.03 
 
 
617 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  24.03 
 
 
617 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  24.03 
 
 
617 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.41 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.93 
 
 
660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  23.89 
 
 
617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.75 
 
 
617 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.75 
 
 
617 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  34.14 
 
 
826 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.75 
 
 
617 aa  117  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  23.46 
 
 
617 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  28.27 
 
 
649 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  28.57 
 
 
1095 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  29.22 
 
 
640 aa  111  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  27.58 
 
 
602 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  29.78 
 
 
1217 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.75 
 
 
502 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  29.46 
 
 
705 aa  100  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  29.41 
 
 
675 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.47 
 
 
508 aa  99.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  29.65 
 
 
1013 aa  98.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.78 
 
 
704 aa  98.6  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  23.01 
 
 
656 aa  98.2  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  27.37 
 
 
655 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.75 
 
 
656 aa  95.5  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  24.62 
 
 
1191 aa  92  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  26.74 
 
 
649 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  22.71 
 
 
618 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  21.82 
 
 
611 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  42.52 
 
 
1077 aa  82  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  21.7 
 
 
643 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.45 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.45 
 
 
618 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  22.91 
 
 
646 aa  79  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  24.65 
 
 
695 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.96 
 
 
655 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.02 
 
 
506 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.24 
 
 
654 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.17 
 
 
618 aa  77.4  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  20.89 
 
 
618 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  27.32 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  20.89 
 
 
618 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1955  hypothetical protein  23.95 
 
 
1070 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.574298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.56 
 
 
599 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  24.07 
 
 
655 aa  75.1  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.94 
 
 
611 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  23.92 
 
 
611 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.7 
 
 
609 aa  70.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>