208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2679 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  100 
 
 
465 aa  919    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  81.78 
 
 
468 aa  710    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  70.46 
 
 
475 aa  624  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  50.43 
 
 
462 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  52.62 
 
 
439 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  47.35 
 
 
465 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  50.94 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  53.26 
 
 
450 aa  401  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  46.89 
 
 
471 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 
471 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  45.57 
 
 
471 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  45.2 
 
 
463 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  44.81 
 
 
461 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  45.27 
 
 
471 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  45.27 
 
 
471 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  44.66 
 
 
465 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  45.6 
 
 
463 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  43.19 
 
 
472 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  44.03 
 
 
472 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  47.58 
 
 
475 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  45.56 
 
 
478 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  45.48 
 
 
466 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  46.92 
 
 
466 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  42.79 
 
 
476 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  48.45 
 
 
478 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  47.63 
 
 
466 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  48.93 
 
 
447 aa  347  3e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  46.56 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 
444 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 
417 aa  333  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  45.45 
 
 
441 aa  332  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  46.6 
 
 
449 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  45.49 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  45.78 
 
 
462 aa  318  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  44.34 
 
 
429 aa  309  8e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  41.03 
 
 
515 aa  306  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 
452 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  39.63 
 
 
516 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  39.43 
 
 
516 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
504 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  41.1 
 
 
482 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
482 aa  289  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
447 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  40.05 
 
 
443 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  40.26 
 
 
515 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  38.77 
 
 
457 aa  279  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  42.69 
 
 
461 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  37.42 
 
 
456 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
459 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  39.14 
 
 
454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  37.09 
 
 
457 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  40 
 
 
452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  34.6 
 
 
550 aa  269  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  35.39 
 
 
553 aa  260  3e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  37.74 
 
 
455 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  39.07 
 
 
431 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  38.95 
 
 
460 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  38.59 
 
 
388 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  33.03 
 
 
450 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  36.64 
 
 
412 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  31.41 
 
 
447 aa  241  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  33.71 
 
 
451 aa  240  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  39.39 
 
 
443 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  37.44 
 
 
409 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.16 
 
 
428 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 
416 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  32.8 
 
 
437 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  32.8 
 
 
437 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  32.8 
 
 
437 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  36.32 
 
 
453 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  32.8 
 
 
437 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  32.8 
 
 
437 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  32.8 
 
 
437 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  32.8 
 
 
437 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  36.64 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  33.49 
 
 
437 aa  226  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  32.13 
 
 
424 aa  226  9e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  31.97 
 
 
462 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  49.55 
 
 
1565 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  49.55 
 
 
1565 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  30.9 
 
 
473 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  35.66 
 
 
492 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  32.49 
 
 
409 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  32.03 
 
 
464 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  31.62 
 
 
464 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  38.66 
 
 
475 aa  220  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  30.58 
 
 
473 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  30.9 
 
 
473 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  30.9 
 
 
473 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  35.29 
 
 
429 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  32.52 
 
 
491 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  32.52 
 
 
491 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  32.52 
 
 
491 aa  216  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 
425 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  32.52 
 
 
491 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  32.52 
 
 
491 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  35.06 
 
 
429 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  35.5 
 
 
450 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>