More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2676 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2676  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
67 aa  137  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000256327  unclonable  1.4308e-18 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2559  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 
67 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0164583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0492  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 
67 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  72.73 
 
 
67 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1093  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 
72 aa  97.8  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4042  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
67 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  67.69 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
67 aa  94  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
67 aa  94  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  68.18 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  66.67 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  66.67 
 
 
69 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
70 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  65.67 
 
 
70 aa  93.6  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 
67 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
69 aa  93.6  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114675  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1274  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2588  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.110334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  68.18 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  66.67 
 
 
69 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 
67 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 
77 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  65.15 
 
 
69 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
67 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  65.15 
 
 
69 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  65.15 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1681  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
69 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1291  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.515471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2596  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111063  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
67 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  65.15 
 
 
69 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 
67 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0855  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 
68 aa  90.5  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.563444  normal  0.445485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  65.15 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0679  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 
68 aa  90.5  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.233328  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.044588  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1151  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114699  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  65.15 
 
 
69 aa  90.5  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.535982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
67 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 
67 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1715  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
69 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0167  cold-shock domain-contain protein  61.19 
 
 
67 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>