28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2455 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2455  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000416249  normal  0.293758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  47.14 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  44.29 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  47.76 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0396  hypothetical protein  45.31 
 
 
91 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.36 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.36 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  43.06 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  46.97 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  40 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  37.31 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  42.25 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  38.89 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  44.12 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  38.89 
 
 
189 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.86 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  43.06 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.28 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0430  hypothetical protein  41.18 
 
 
87 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.28 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 
198 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
325 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2427  hypothetical protein  35.09 
 
 
77 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0294541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>