118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2405 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 402 aa  819    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 367 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  22.77 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.42 
 
 		 378 aa  87  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  21.87 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  26.14 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.34 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  29.11 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  23.26 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  33.64 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  20.52 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  29.82 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  24.87 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  22.66 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  26.79 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  24.6 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  27.59 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  20.38 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 588 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  25.42 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.27 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  26.65 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4621  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  24 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  24.82 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  29.27 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  26.05 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  22.25 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4098  LuxR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000762213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  29.08 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  25.07 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6253  transcriptional regulator, LuxR family  34.05 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  25.79 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  32.18 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 232 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  27.72 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  26.02 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  43.42 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  20.61 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 435 aa  49.7  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4118  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 213 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 213 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 187 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3945  regulatory protein, LuxR  43.75 
 
 		 191 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.63683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 229 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 188 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 347 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 919 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3770  regulatory protein, LuxR  25.57 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00240032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  25.13 
 
 		 381 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  25.21 
 
 		 325 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>