62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2385 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  100 
 
 
424 aa  818    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2388  general secretion pathway protein L  37.04 
 
 
410 aa  170  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  34.6 
 
 
412 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  30.59 
 
 
399 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  26.95 
 
 
397 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  26.11 
 
 
400 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  27.85 
 
 
396 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  28.17 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  27.53 
 
 
425 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  25.71 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  28.11 
 
 
399 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  27.07 
 
 
435 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  30.75 
 
 
379 aa  103  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  26.68 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  26.68 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  26.68 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  23.29 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  24.83 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  26.4 
 
 
395 aa  96.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  23.2 
 
 
400 aa  96.3  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  27.18 
 
 
395 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  27.16 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  27.15 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  25.12 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  25.91 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  22.92 
 
 
403 aa  87.8  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  23.13 
 
 
400 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  24.71 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  27.44 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  25.82 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  27.34 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  25.94 
 
 
396 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  28.13 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  26.28 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  27.32 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  26.41 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  27 
 
 
475 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  27.74 
 
 
379 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  26.37 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  24.61 
 
 
381 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  19.33 
 
 
396 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  19.69 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1836  hypothetical protein  19.05 
 
 
379 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  27.99 
 
 
404 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1839  hypothetical protein  19.05 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  26.76 
 
 
475 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2586  general secretion pathway L  39.13 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2537  general secretion pathway protein L  28.99 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  35.34 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  22.36 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.682274 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  26.88 
 
 
280 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  37.5 
 
 
382 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  39.58 
 
 
453 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  24.62 
 
 
292 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  39.58 
 
 
457 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  39.58 
 
 
457 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  39.58 
 
 
456 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  39.58 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0149  Type II secretory pathway component PulL-like protein  26.18 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  38.54 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  37.5 
 
 
468 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  35.06 
 
 
411 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>