More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2347 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  58.57 
 
 		 589 aa  710    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1158    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  69.56 
 
 		 588 aa  764    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  51.1 
 
 		 589 aa  598  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  51.53 
 
 		 588 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  51.02 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  52.04 
 
 		 587 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  47.28 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  42.14 
 
 		 591 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  42.98 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  45.58 
 
 		 591 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  40.78 
 
 		 622 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  40.03 
 
 		 634 aa  397  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  40.27 
 
 		 592 aa  386  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  39.31 
 
 		 572 aa  354  2.9999999999999997e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  32.61 
 
 		 593 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 575 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.49 
 
 		 598 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  35.02 
 
 		 575 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 		 575 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 		 575 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.73 
 
 		 596 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.6 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.99 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.99 
 
 		 596 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  33.84 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  33.05 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  33.84 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  36.47 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  35.31 
 
 		 574 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 		 574 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.27 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.54 
 
 		 596 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  31.71 
 
 		 596 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  32.21 
 
 		 575 aa  286  8e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.61 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  34.08 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.02 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.56 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.4 
 
 		 607 aa  281  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.65 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.56 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34.32 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.93 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.89 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  33.9 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  33.56 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.36 
 
 		 622 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  37.04 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  33.9 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.31 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  33.9 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.95 
 
 		 623 aa  261  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.31 
 
 		 574 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  35.48 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.1 
 
 		 624 aa  257  5e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  35.14 
 
 		 574 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.95 
 
 		 596 aa  256  6e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34.57 
 
 		 599 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  33.56 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 592 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.57 
 
 		 613 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 613 aa  252  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.4 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.8 
 
 		 616 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.01 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.98 
 
 		 608 aa  246  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 		 592 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.78 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 		 592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.15 
 
 		 627 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.15 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.74 
 
 		 593 aa  241  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.73 
 
 		 605 aa  241  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  31.74 
 
 		 592 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  31.74 
 
 		 592 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.14 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.72 
 
 		 594 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.99 
 
 		 630 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.66 
 
 		 601 aa  236  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.99 
 
 		 610 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.3 
 
 		 609 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.79 
 
 		 609 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.99 
 
 		 610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  32.38 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.74 
 
 		 605 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.74 
 
 		 605 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  32.8 
 
 		 618 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.07 
 
 		 614 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  31.93 
 
 		 591 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  30.54 
 
 		 620 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  30.73 
 
 		 602 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.8 
 
 		 641 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  32.43 
 
 		 627 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 		 605 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  33.04 
 
 		 596 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.41 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.54 
 
 		 606 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>