108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2314 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  772    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  38.96 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  38.96 
 
 
367 aa  282  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  35.85 
 
 
369 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  34.32 
 
 
378 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  36.04 
 
 
364 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  33.51 
 
 
368 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  32.89 
 
 
377 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  36.04 
 
 
370 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  36.04 
 
 
370 aa  208  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  34.68 
 
 
363 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  34.41 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  33.68 
 
 
378 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  34.23 
 
 
370 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  34.81 
 
 
384 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  37.11 
 
 
370 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  34.15 
 
 
369 aa  189  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  32.21 
 
 
416 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  32.8 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  31.64 
 
 
373 aa  179  8e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  30.25 
 
 
357 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  33.51 
 
 
378 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  32 
 
 
364 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.38 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.38 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  24.81 
 
 
382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  26.87 
 
 
386 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.94 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.71 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.69 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.56 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.3 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.25 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  28.74 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  21.09 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.25 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.24 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  26.18 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  24.81 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  25.07 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  23.78 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.6 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.23 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  30.77 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.2 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  25.65 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.29 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  26.47 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  26.89 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.61 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.65 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  23.48 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  25.13 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  30.51 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  22.69 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  25.55 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25.21 
 
 
367 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.77 
 
 
226 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  22.75 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1696  hypothetical protein  32.17 
 
 
641 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  25.21 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  22.03 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  22.03 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  37.5 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  24.14 
 
 
384 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0337  SMC domain protein  17.99 
 
 
427 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  25.45 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  26.07 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3552  hypothetical protein  26.92 
 
 
416 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  22.14 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  22.42 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1883  hypothetical protein  23.89 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  30.28 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  23.56 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.87 
 
 
385 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.06 
 
 
642 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1095  hypothetical protein  31.67 
 
 
453 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00653553  hitchhiker  0.00178411 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  34.02 
 
 
676 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  25.68 
 
 
405 aa  47  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  50.88 
 
 
595 aa  47  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  23.47 
 
 
450 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.21 
 
 
708 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  40.98 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  30.91 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  31.4 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1950  hypothetical protein  32.22 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00278389  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  30.91 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  37.7 
 
 
697 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  42.11 
 
 
695 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  37.88 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  37.88 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  39.29 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  37.35 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  24.58 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  43.1 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  39.71 
 
 
1011 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  43.33 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  30.84 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>