More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2276 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2276  TonB-dependent receptor  100 
 
 
751 aa  1509    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 
676 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1561  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 
681 aa  331  4e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000105774  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 
699 aa  275  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 
706 aa  269  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.73 
 
 
653 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
707 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.34 
 
 
656 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
649 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
694 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  24.68 
 
 
652 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 
714 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 
688 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
705 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1088  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 
679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
661 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1797  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 
647 aa  111  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  33.19 
 
 
633 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
652 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
662 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 
662 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 
662 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
680 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.66 
 
 
646 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
681 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
702 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  36.08 
 
 
639 aa  105  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  23.13 
 
 
759 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  23.26 
 
 
751 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  23.26 
 
 
751 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 
634 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  23.26 
 
 
751 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  23.26 
 
 
751 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.23 
 
 
650 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.23 
 
 
650 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.23 
 
 
650 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.23 
 
 
650 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  23.12 
 
 
751 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  22.38 
 
 
748 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.2 
 
 
656 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.23 
 
 
650 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  41.73 
 
 
659 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 
634 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  41.73 
 
 
641 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  41.73 
 
 
663 aa  98.6  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.76 
 
 
613 aa  98.6  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  35.9 
 
 
618 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 
619 aa  96.3  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  23.76 
 
 
746 aa  94  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  23.78 
 
 
623 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  32.77 
 
 
640 aa  93.6  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 
653 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.36 
 
 
619 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  44.52 
 
 
650 aa  93.6  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 
665 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  23.7 
 
 
661 aa  93.2  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 
653 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 
665 aa  93.2  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  22.84 
 
 
696 aa  92.8  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  24.91 
 
 
641 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 
652 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 
709 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 
653 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 
653 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 
653 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 
680 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 
713 aa  92  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  40.61 
 
 
700 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  40.85 
 
 
620 aa  90.9  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 
624 aa  91.3  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 
653 aa  91.3  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  38.8 
 
 
612 aa  90.9  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  34.34 
 
 
766 aa  90.9  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  40.85 
 
 
697 aa  90.5  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 
617 aa  90.5  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 
757 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.78 
 
 
653 aa  90.5  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  38.65 
 
 
631 aa  90.1  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  24.33 
 
 
623 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0385  TonB-dependent receptor, plug  35.94 
 
 
713 aa  90.5  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 
656 aa  90.5  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
614 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  24.12 
 
 
696 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  38.71 
 
 
326 aa  89.7  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  34.27 
 
 
713 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  41.48 
 
 
653 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 
688 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  38.15 
 
 
613 aa  89.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 
634 aa  88.6  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  39.19 
 
 
653 aa  88.6  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 
657 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 
715 aa  88.2  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3145  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 
787 aa  88.2  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.394815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>