More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2145 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  100 
 
 
472 aa  950    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 
433 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
427 aa  106  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
479 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.36 
 
 
479 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
471 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
482 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
482 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
482 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 
479 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.07 
 
 
471 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
441 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.96 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 
436 aa  90.5  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  26.11 
 
 
503 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 
476 aa  89.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 
1496 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  26.18 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 
471 aa  80.5  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.39 
 
 
470 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.46 
 
 
731 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 
515 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 
627 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  24.61 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.77 
 
 
497 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4130  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.82 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.22 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 
462 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.52 
 
 
508 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.07 
 
 
463 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  24.26 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
635 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.64 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.43 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.64 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  22.33 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  25 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24 
 
 
1470 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
498 aa  73.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  26 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 
738 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.87 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.6 
 
 
435 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  25.91 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.93 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.7 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.25 
 
 
485 aa  70.5  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  21.62 
 
 
501 aa  70.1  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
495 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  23.52 
 
 
453 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  27.95 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.35 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.89 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.29 
 
 
518 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.71 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.71 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.71 
 
 
497 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.61 
 
 
449 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.69 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.92 
 
 
494 aa  67.4  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  25 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  27.25 
 
 
466 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.14 
 
 
469 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  24.76 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.61 
 
 
437 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  21.36 
 
 
463 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.11 
 
 
488 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.11 
 
 
497 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 
528 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  20.09 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
565 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.42 
 
 
480 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>