More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2099 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
289 aa  590  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  62.06 
 
 
284 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  60.99 
 
 
284 aa  355  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  61.57 
 
 
284 aa  354  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 
284 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  59.07 
 
 
284 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  58.36 
 
 
284 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  56.83 
 
 
284 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  55.99 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  56.38 
 
 
287 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 
284 aa  332  6e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  56.99 
 
 
296 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  54.67 
 
 
288 aa  328  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 
293 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  53.9 
 
 
287 aa  318  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 
296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  57.45 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 
288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 
309 aa  311  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 
287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  55.67 
 
 
286 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  55.16 
 
 
299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  53.76 
 
 
283 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 
300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 
289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  55.56 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  54.36 
 
 
285 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
284 aa  298  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
284 aa  297  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  53.1 
 
 
290 aa  296  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  52.16 
 
 
288 aa  292  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  50.7 
 
 
284 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
287 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 
284 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
283 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
283 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
284 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 
285 aa  287  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 
284 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  51.59 
 
 
294 aa  286  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 
284 aa  286  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 
287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  51.24 
 
 
283 aa  285  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
296 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  51.58 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  51.22 
 
 
307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.33 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 
285 aa  279  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 
284 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 
283 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
290 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  49.09 
 
 
284 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 
289 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  51.04 
 
 
287 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 
284 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  49.47 
 
 
297 aa  278  8e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  47 
 
 
282 aa  278  9e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 
284 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
296 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  51.06 
 
 
297 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  50.35 
 
 
282 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 
291 aa  275  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  52.14 
 
 
283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 
297 aa  272  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  47.78 
 
 
295 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  51.57 
 
 
299 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 
284 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 
282 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 
282 aa  268  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
282 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 
282 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.61 
 
 
285 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
282 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  48.97 
 
 
316 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3546  formyltetrahydrofolate deformylase  47.28 
 
 
295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 
302 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
307 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  46.5 
 
 
286 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 
282 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 
282 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  48.97 
 
 
295 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  47.92 
 
 
303 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  44.33 
 
 
284 aa  261  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 
294 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  46.85 
 
 
294 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  45.64 
 
 
289 aa  260  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 
293 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>