More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1980 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  312  1e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  82.8 
 
 
158 aa  260  7e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  76.43 
 
 
158 aa  251  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  72.61 
 
 
172 aa  236  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  72.61 
 
 
159 aa  236  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  73.25 
 
 
158 aa  234  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  73.25 
 
 
158 aa  233  5e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
158 aa  232  1e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
158 aa  229  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
158 aa  228  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
176 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  227  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
158 aa  227  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
158 aa  227  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
158 aa  227  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  226  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  69.43 
 
 
158 aa  225  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  225  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
168 aa  223  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
158 aa  223  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
158 aa  223  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  69.43 
 
 
158 aa  223  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  221  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  221  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  220  5e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.10708e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.74781e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.10908e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.61642e-05  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  219  1e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.19579e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  219  1e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.58072e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  218  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 
158 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  65.61 
 
 
158 aa  217  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  217  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  217  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  69.74 
 
 
153 aa  217  5e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  68.79 
 
 
160 aa  217  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.7905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  69.68 
 
 
159 aa  216  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
159 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  65.61 
 
 
158 aa  216  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.43014e-05  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  216  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  65.61 
 
 
158 aa  215  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 
173 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  69.43 
 
 
158 aa  214  6e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  66.24 
 
 
180 aa  213  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 
158 aa  212  2e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
158 aa  211  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.2178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
158 aa  211  4e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.72965e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
158 aa  211  4e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  210  5e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
158 aa  210  5e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
160 aa  210  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
160 aa  210  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 
159 aa  209  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 
158 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  63.87 
 
 
158 aa  209  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  65.61 
 
 
171 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 
158 aa  207  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
158 aa  207  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  64.71 
 
 
158 aa  207  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  66.45 
 
 
158 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 
156 aa  205  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  63.16 
 
 
154 aa  204  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
158 aa  204  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 
158 aa  204  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  62.42 
 
 
158 aa  201  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 
156 aa  201  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 
156 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
158 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  63.87 
 
 
158 aa  200  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  63.87 
 
 
158 aa  200  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  62.42 
 
 
156 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  62.42 
 
 
156 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
158 aa  199  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.41028e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 
158 aa  199  1e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
158 aa  199  1e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>